151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003777 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  100 
 
 		 326 aa  681    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  48.15 
 
 		 318 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  49.35 
 
 		 304 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  52.61 
 
 		 318 aa  301  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  49.69 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  46.71 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  45.85 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  47.22 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  51.72 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  45.78 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  46.6 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  46.27 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  45.99 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  47.02 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  44.44 
 
 		 328 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  45.81 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  45.81 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  45.21 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  45.99 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  46.91 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  47.8 
 
 		 321 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  46.3 
 
 		 316 aa  295  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  47.8 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  44.91 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  46.6 
 
 		 321 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  46.91 
 
 		 319 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  45.51 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  47.8 
 
 		 321 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  44.91 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  45.92 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  45.51 
 
 		 333 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  50.52 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  45.65 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  44.44 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  44.61 
 
 		 329 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  46.3 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  44.91 
 
 		 333 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  45.06 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  45.68 
 
 		 316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  45.25 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  48.63 
 
 		 312 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  48.04 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  43.99 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  42.86 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  43.77 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  39.3 
 
 		 317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  40.28 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  40.81 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  38.18 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  38.55 
 
 		 540 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  36.88 
 
 		 577 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  39.81 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  32.63 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  30.09 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  31.83 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  31.93 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  31.17 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  33.09 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  33.21 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  33.49 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  26.16 
 
 		 658 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  29.28 
 
 		 646 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  28.83 
 
 		 658 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  33.47 
 
 		 449 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  27.67 
 
 		 656 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  28.1 
 
 		 658 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  27.33 
 
 		 650 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  28.83 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  25.86 
 
 		 650 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  27.6 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  29.41 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  24.1 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  27.05 
 
 		 427 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  25.53 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  27.57 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  26.14 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  27.66 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  29.47 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.37 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  34.09 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  31.09 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.37 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.37 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.37 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  28.95 
 
 		 436 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.37 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  28.95 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  28.04 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  26.98 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.81 
 
 		 189 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.86 
 
 		 189 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  30.69 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  30.69 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  30.69 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.69 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.69 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.69 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.69 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.69 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.69 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>