93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3839 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  100 
 
 
330 aa  694    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  53.33 
 
 
330 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  52.15 
 
 
330 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  31.96 
 
 
331 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0260  hypothetical protein  35.36 
 
 
212 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  31.1 
 
 
442 aa  86.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  32.54 
 
 
426 aa  85.9  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  32.85 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  31.4 
 
 
480 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  32.86 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  31.71 
 
 
434 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  27.6 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  29.73 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  28.97 
 
 
650 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  27.88 
 
 
427 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  32.2 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  28.5 
 
 
656 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  27.19 
 
 
650 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  28.11 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  31.03 
 
 
658 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  31.19 
 
 
658 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  29.06 
 
 
658 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  26.5 
 
 
487 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  30.39 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  30.39 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  29.9 
 
 
436 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  28.7 
 
 
358 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  28.89 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  28.7 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3161  cytochrome C family protein  29.2 
 
 
201 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3223  cytochrome c family protein  30.43 
 
 
195 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  28.71 
 
 
646 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  30.52 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2757  cytochrome C family protein  29.66 
 
 
201 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  24.08 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  29.14 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  33.07 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  34.35 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  28.16 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  27.36 
 
 
884 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  27.78 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  28.25 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  24.29 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  30.86 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  25.27 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  25.29 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3111  cytochrome C family protein  25 
 
 
204 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  25.27 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  28.16 
 
 
333 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  27.78 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  25.89 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  28.33 
 
 
1294 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  25.89 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  29.21 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  25.45 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  25.45 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  29.26 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  25.37 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  24.54 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  27.06 
 
 
316 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  24.17 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  26.63 
 
 
806 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  26.47 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  27.03 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  25.11 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  35.71 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  25.87 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  25.51 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  24.21 
 
 
540 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  26.84 
 
 
304 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  23.89 
 
 
322 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  24.87 
 
 
618 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  24.35 
 
 
655 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  24.02 
 
 
664 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  26.7 
 
 
335 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  22.96 
 
 
618 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  26.47 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  27.87 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  28.44 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  25.71 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  25.76 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  24.87 
 
 
619 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  26.55 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  33.65 
 
 
577 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  27.06 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  24.89 
 
 
1017 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  26.01 
 
 
1009 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  26.75 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  24.09 
 
 
930 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  27.75 
 
 
317 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  26.14 
 
 
1106 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  25.88 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>