158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2506 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  100 
 
 		 321 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  99.69 
 
 		 321 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  99.07 
 
 		 321 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  91.9 
 
 		 321 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  91.28 
 
 		 321 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  91.85 
 
 		 319 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  97.06 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  91.28 
 
 		 321 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  75.08 
 
 		 321 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  78.26 
 
 		 322 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  72.9 
 
 		 319 aa  501  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  76.03 
 
 		 318 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  67.17 
 
 		 333 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  68.87 
 
 		 333 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  68.87 
 
 		 333 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  68.87 
 
 		 333 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  68.55 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  68.89 
 
 		 329 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  68.89 
 
 		 329 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  68.57 
 
 		 329 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  65.65 
 
 		 329 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  65.17 
 
 		 333 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  65.17 
 
 		 333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  67.19 
 
 		 329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  65.33 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  63.94 
 
 		 334 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  62.92 
 
 		 328 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  60.45 
 
 		 317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  59.24 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  58.86 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  57.55 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  57.64 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  55.56 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  57.47 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  58.55 
 
 		 316 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  57.19 
 
 		 316 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  58.5 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  58.63 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  55.13 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  58.28 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  54.95 
 
 		 310 aa  322  8e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  47.8 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  45.57 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  48.6 
 
 		 286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  48.87 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  40.07 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  38.44 
 
 		 307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  38.57 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  38.24 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  38.79 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  35.91 
 
 		 540 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  35.11 
 
 		 577 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  31.99 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  31.72 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  31.63 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  32.65 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  29.33 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  30.16 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  37.86 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  29.97 
 
 		 658 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  28.35 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  28.42 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  26.71 
 
 		 658 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  26.69 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.15 
 
 		 650 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  30.57 
 
 		 658 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  29.2 
 
 		 646 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  27.72 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  31.54 
 
 		 154 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  27.2 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  29.41 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  29.82 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  25.74 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  28.24 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  27.74 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  36.84 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  29.84 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  29.79 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  29.79 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  27.4 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  29.26 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  28.37 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  29.02 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  29.23 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  28.72 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  28.72 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  28.91 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0182  formate-dependent nitrite reductase  26.17 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.86 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.86 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.86 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.86 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.86 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  29.85 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.33 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  29.69 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  27.81 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0181  formate-dependent nitrite reductase  26.17 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>