115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2494 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  100 
 
 
434 aa  892    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  66.67 
 
 
427 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  57.77 
 
 
426 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  51.57 
 
 
436 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  51.57 
 
 
436 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  50.79 
 
 
436 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  48.44 
 
 
429 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  39.44 
 
 
656 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  35.91 
 
 
658 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  39.44 
 
 
650 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  38.5 
 
 
650 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  33.09 
 
 
658 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  35.08 
 
 
658 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  33.21 
 
 
646 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  37.02 
 
 
337 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  34.31 
 
 
449 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  34.66 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  31.25 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  32.17 
 
 
442 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  37.97 
 
 
362 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  37.1 
 
 
331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  28.99 
 
 
487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  28 
 
 
480 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  34.5 
 
 
331 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  32.54 
 
 
330 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  27.34 
 
 
577 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  29.74 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  25.84 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  29.51 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  29.92 
 
 
358 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  31.71 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  31.71 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  31.12 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  26.6 
 
 
316 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  28.64 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  32.68 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  31.67 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  27.27 
 
 
304 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  29.05 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  31.19 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  29.41 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3161  cytochrome C family protein  43.27 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  27.47 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  28.43 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  28.22 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  30.58 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  27.94 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  26.96 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  25.62 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  27.32 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  26.8 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  32.12 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  32.12 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  28.64 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  32.12 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  28.86 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  31.11 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  26.53 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  31.5 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  29.35 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  30.37 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  28.5 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  30.37 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  27.82 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  30.73 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  30.91 
 
 
333 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  31.03 
 
 
334 aa  67  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  32.81 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  26.56 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2757  cytochrome C family protein  43.01 
 
 
201 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  30.67 
 
 
333 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  30.67 
 
 
333 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  27.08 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  30.67 
 
 
333 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  29.84 
 
 
321 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  29.84 
 
 
321 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  29.84 
 
 
321 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  29.33 
 
 
326 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  29.69 
 
 
321 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  30.35 
 
 
286 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  26.29 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  28.64 
 
 
317 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  25 
 
 
299 aa  63.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  29.32 
 
 
306 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  27.16 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  25.24 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  26.98 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3223  cytochrome c family protein  31.3 
 
 
195 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  28.93 
 
 
287 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0260  hypothetical protein  31.28 
 
 
212 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  27.4 
 
 
322 aa  60.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  32.37 
 
 
307 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3111  cytochrome C family protein  38.82 
 
 
204 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  28.1 
 
 
310 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  30.73 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  27.22 
 
 
553 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  33.6 
 
 
571 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  27.41 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  27.04 
 
 
655 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  26.89 
 
 
259 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>