167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3126 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  100 
 
 		 333 aa  693    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  89.79 
 
 		 333 aa  630  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  87.39 
 
 		 329 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  86.49 
 
 		 328 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  86.25 
 
 		 329 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  85.94 
 
 		 329 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  85.94 
 
 		 329 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  83.18 
 
 		 333 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  83.18 
 
 		 333 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  82.88 
 
 		 333 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  82.88 
 
 		 333 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  82.28 
 
 		 333 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  81.19 
 
 		 334 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  81.4 
 
 		 326 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  78.48 
 
 		 329 aa  558  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  66.07 
 
 		 321 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  66.07 
 
 		 321 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  66.07 
 
 		 319 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  65.77 
 
 		 321 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  65.17 
 
 		 321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  65.17 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  66.07 
 
 		 321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  66.03 
 
 		 306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  65.2 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  63.83 
 
 		 319 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  67.22 
 
 		 318 aa  434  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  66.01 
 
 		 322 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  61.63 
 
 		 316 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  65.26 
 
 		 314 aa  427  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  62.97 
 
 		 316 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  61.88 
 
 		 312 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  59.33 
 
 		 316 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  60.74 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  61.66 
 
 		 317 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  61.56 
 
 		 318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  58.41 
 
 		 309 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  58.6 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  58.73 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  57.59 
 
 		 315 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  59.02 
 
 		 304 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  55.38 
 
 		 310 aa  340  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  49.68 
 
 		 304 aa  315  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  45.78 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  49.55 
 
 		 286 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  48.05 
 
 		 287 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  41.82 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  45.65 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  43.11 
 
 		 299 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  44.3 
 
 		 315 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  40.62 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  36.33 
 
 		 540 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  36.33 
 
 		 577 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  31.18 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  31.12 
 
 		 363 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  30.93 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  33.1 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  29.6 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  32.4 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  35.32 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  32.03 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  29.21 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  28.36 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  31.38 
 
 		 646 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  28.91 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 658 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  25.68 
 
 		 658 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  28.25 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  32.05 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  31.79 
 
 		 650 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  31.79 
 
 		 656 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  27.84 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  31.13 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  27.34 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  34.62 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  28.82 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  29.36 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  28.87 
 
 		 658 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  28.27 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  33.6 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  30 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  30 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.57 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.57 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.57 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.57 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  30.51 
 
 		 442 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  33.83 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.03 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  31.64 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  29.7 
 
 		 427 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  27.17 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  32.65 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  26.7 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>