More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2887 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  100 
 
 		 884 aa  1789    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  66.25 
 
 		 806 aa  941    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  61.03 
 
 		 712 aa  771    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.3 
 
 		 639 aa  97.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  35.23 
 
 		 623 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  30.21 
 
 		 873 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  39.05 
 
 		 967 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  63.49 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  58.82 
 
 		 816 aa  78.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2294  cytochrome c family protein  31.61 
 
 		 179 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.75 
 
 		 945 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  52.38 
 
 		 1150 aa  75.1  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  47.13 
 
 		 1057 aa  74.7  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  39.18 
 
 		 814 aa  74.7  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  50 
 
 		 2066 aa  74.7  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  30.77 
 
 		 965 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  34.95 
 
 		 965 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  31.54 
 
 		 965 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  26.67 
 
 		 655 aa  73.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  30.77 
 
 		 965 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  30.77 
 
 		 965 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  50 
 
 		 969 aa  72.4  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  31.54 
 
 		 965 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  49.33 
 
 		 792 aa  72  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  51.9 
 
 		 1916 aa  72  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  30.77 
 
 		 965 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  34.95 
 
 		 965 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2808  cytochrome c family protein  35.04 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000226609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  34.95 
 
 		 965 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  45.45 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  45.45 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  34.95 
 
 		 965 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  45.45 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  45.45 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  41.05 
 
 		 971 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  45.45 
 
 		 971 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  52.94 
 
 		 943 aa  70.5  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.05 
 
 		 6885 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  22.03 
 
 		 658 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  42.86 
 
 		 971 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.45 
 
 		 1200 aa  68.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  36.17 
 
 		 1104 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  38.1 
 
 		 1104 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.36 
 
 		 953 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  44.74 
 
 		 861 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  42.55 
 
 		 1081 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  42.86 
 
 		 971 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  44.9 
 
 		 734 aa  68.2  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  42.86 
 
 		 1018 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  45.83 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  44.25 
 
 		 521 aa  67  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  42.68 
 
 		 1050 aa  67.4  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  60 
 
 		 1565 aa  67.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  24.41 
 
 		 658 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  24.03 
 
 		 646 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  55.74 
 
 		 778 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  57.35 
 
 		 3197 aa  66.6  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  55.74 
 
 		 778 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  44.3 
 
 		 1601 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  55.74 
 
 		 778 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  42.11 
 
 		 971 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  54.55 
 
 		 823 aa  65.1  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  48.86 
 
 		 3197 aa  65.1  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  46.58 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  61.54 
 
 		 778 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  41.43 
 
 		 960 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  41.43 
 
 		 960 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  43.18 
 
 		 775 aa  63.9  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  39.74 
 
 		 960 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  54.24 
 
 		 918 aa  63.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  51.61 
 
 		 780 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  39.66 
 
 		 848 aa  63.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  41.18 
 
 		 400 aa  63.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  24.23 
 
 		 902 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  54.72 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  41.84 
 
 		 1771 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  49.18 
 
 		 777 aa  61.2  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  24.78 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.41 
 
 		 757 aa  61.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  42.05 
 
 		 1029 aa  61.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.11 
 
 		 601 aa  60.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  47.76 
 
 		 517 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  38.1 
 
 		 677 aa  60.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  44.12 
 
 		 1084 aa  60.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  22.96 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  50 
 
 		 852 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  26.84 
 
 		 688 aa  60.1  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  51.56 
 
 		 487 aa  60.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  41.18 
 
 		 669 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2076  cytochrome c family protein  32.19 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1436  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  47.89 
 
 		 948 aa  59.3  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  24.05 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.66 
 
 		 1004 aa  58.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  47.44 
 
 		 774 aa  58.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  25.16 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.86 
 
 		 773 aa  57.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  23.79 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  26.68 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.53 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  46.27 
 
 		 1151 aa  57.8  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>