61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2323 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  94.71 
 
 		 340 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  73.53 
 
 		 340 aa  535  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  61.81 
 
 		 340 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  62.81 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  57.19 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  50.14 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  47.67 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  47.54 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  50 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  46.63 
 
 		 717 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  46.38 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 479 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  40.88 
 
 		 711 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  46.69 
 
 		 709 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  44.74 
 
 		 254 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  45.76 
 
 		 252 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  55.98 
 
 		 181 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  52.63 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  49.33 
 
 		 100 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  28.45 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  30.5 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  46.58 
 
 		 102 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  42.7 
 
 		 160 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  27.09 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  43.84 
 
 		 102 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  39.29 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  42.03 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.24 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  26.05 
 
 		 580 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  25.1 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  25.91 
 
 		 413 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  38.67 
 
 		 130 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  25.82 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  27.45 
 
 		 458 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  32.14 
 
 		 267 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  22.49 
 
 		 655 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.2 
 
 		 712 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  25.59 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  25.63 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  40.54 
 
 		 112 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  25.98 
 
 		 288 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  25.52 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  25.63 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  25.73 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  37.5 
 
 		 199 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  24.03 
 
 		 1038 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  24.14 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  22.91 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  23.96 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.56 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  23.79 
 
 		 1645 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  21.84 
 
 		 538 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  26.57 
 
 		 288 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  25.25 
 
 		 219 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>