25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2645 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  100 
 
 		 291 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  74.92 
 
 		 305 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  52.42 
 
 		 280 aa  278  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  52.29 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  36.8 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  37.71 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  38.14 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  37.07 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  26.55 
 
 		 655 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  29.2 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  26.29 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  24.83 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  24.83 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.38 
 
 		 806 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  25.08 
 
 		 436 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  26.43 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  25.11 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  26.64 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  24.06 
 
 		 664 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  27.48 
 
 		 656 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 650 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  23.48 
 
 		 621 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  24.07 
 
 		 670 aa  42.4  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  23.49 
 
 		 479 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>