84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1789 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  100 
 
 		 280 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  94.64 
 
 		 280 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  51.69 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  49.31 
 
 		 305 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  38.38 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  40.79 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  39.06 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  36.59 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  33.82 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  25.38 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  25.39 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  27.59 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  26.2 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  30 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  27.75 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  27.63 
 
 		 487 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  27.01 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  26.4 
 
 		 884 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  26.94 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  27.07 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  21.94 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  22.11 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  22.39 
 
 		 299 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  27.32 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  25.96 
 
 		 427 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  29.71 
 
 		 650 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  29.71 
 
 		 656 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  25.14 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  25.97 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  24.22 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  26.16 
 
 		 436 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  24.33 
 
 		 717 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  21.78 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  21.78 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  30.95 
 
 		 650 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  25.91 
 
 		 867 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  24.64 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  24.26 
 
 		 664 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  22.85 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  23.38 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  24.07 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  25.32 
 
 		 436 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  27.33 
 
 		 658 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  25.32 
 
 		 436 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  24.38 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  24.09 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  23.86 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  22.58 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  22.58 
 
 		 321 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  25.41 
 
 		 646 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  24.27 
 
 		 543 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  25.15 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  23.19 
 
 		 326 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  23.88 
 
 		 340 aa  45.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.69 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  24.46 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  23.05 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  22.58 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  25.93 
 
 		 658 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  21.82 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  21.82 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  31.01 
 
 		 812 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  23.05 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  23.38 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  21.82 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  25.47 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  23.83 
 
 		 658 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  23 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  24.49 
 
 		 440 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  26.56 
 
 		 656 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  27.64 
 
 		 578 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  22.61 
 
 		 333 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  25.58 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  23.75 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  24.5 
 
 		 712 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  24.5 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  28.26 
 
 		 1106 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  22.59 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  29.01 
 
 		 610 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  24.84 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  25.12 
 
 		 340 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  22.18 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  25.4 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>