79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3135 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  56.33 
 
 		 711 aa  860    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  100 
 
 		 717 aa  1459    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  62.27 
 
 		 709 aa  897    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  43.83 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  47.2 
 
 		 340 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  50.3 
 
 		 329 aa  280  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  45.95 
 
 		 340 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  48.35 
 
 		 329 aa  272  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  46.11 
 
 		 340 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  47.59 
 
 		 330 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  44.9 
 
 		 335 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  46.31 
 
 		 340 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  46.77 
 
 		 330 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  46.08 
 
 		 343 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  44.51 
 
 		 337 aa  250  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  49.6 
 
 		 254 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  42.52 
 
 		 252 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  42.61 
 
 		 181 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  23.51 
 
 		 655 aa  81.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  51.35 
 
 		 100 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  20.89 
 
 		 867 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  42 
 
 		 102 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  31.08 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  28.15 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  22.2 
 
 		 621 aa  67.4  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  27.7 
 
 		 266 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  28.51 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.57 
 
 		 426 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  24.56 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  27.8 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  43.84 
 
 		 112 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  21.33 
 
 		 1329 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  22.84 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  38.37 
 
 		 126 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  24.16 
 
 		 267 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  42.47 
 
 		 112 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  34.31 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  42.47 
 
 		 112 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  22.98 
 
 		 600 aa  56.6  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  21.39 
 
 		 620 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  41.1 
 
 		 113 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  33.8 
 
 		 199 aa  55.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  22.22 
 
 		 2081 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  20.83 
 
 		 1329 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  42.03 
 
 		 106 aa  54.3  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  21.88 
 
 		 790 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  23.63 
 
 		 344 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  23.58 
 
 		 344 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  27.14 
 
 		 219 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  23.58 
 
 		 344 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  20.77 
 
 		 1330 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.18 
 
 		 806 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  31.46 
 
 		 125 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  21.04 
 
 		 618 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.76 
 
 		 326 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  23.37 
 
 		 580 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  23.78 
 
 		 656 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  21.2 
 
 		 955 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  24.33 
 
 		 280 aa  48.5  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  22.54 
 
 		 252 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  23.88 
 
 		 655 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  24.75 
 
 		 280 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  22.96 
 
 		 957 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  37.88 
 
 		 160 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  22.27 
 
 		 1525 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  25.82 
 
 		 305 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  45.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  25.56 
 
 		 1106 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.55 
 
 		 650 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  21.63 
 
 		 664 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  23.37 
 
 		 794 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  22.99 
 
 		 655 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  22.55 
 
 		 1281 aa  44.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  29.17 
 
 		 2912 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  23.53 
 
 		 1017 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  23.5 
 
 		 650 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  22.33 
 
 		 757 aa  44.3  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>