213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3546 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
326 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0475  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  38.67 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2676  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  32.43 
 
 
245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0612561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3354  hypothetical protein  34.07 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5677  hypothetical protein  34.51 
 
 
261 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253035  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3613  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  32.42 
 
 
252 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.28 
 
 
272 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  33.33 
 
 
271 aa  92.8  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  31.73 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3612  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  30.22 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.694677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  30.28 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  35.4 
 
 
278 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  30.28 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  37.14 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  29.96 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  32.86 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  32.02 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  27.63 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  34.34 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  34.52 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  30.88 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  33.78 
 
 
332 aa  79  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  41.35 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2506  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.37 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000037877  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  37.93 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  26.74 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  32.82 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  27.19 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  31.01 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1491  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.4 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000445289  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  29.75 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  27.09 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  40.2 
 
 
106 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  30.35 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.38 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  26.98 
 
 
279 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  28.12 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  27.16 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  25.76 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.7 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 
558 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  33.11 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  24.62 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  35.48 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  33.11 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  26.59 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  32.45 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  35.14 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.92 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.03 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  29.03 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.62 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  37.04 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  36.84 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  32.39 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  32.26 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  25.35 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  29.19 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  28.16 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  36.04 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  34.92 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  35.14 
 
 
416 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  33.53 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.77 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.61 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 
585 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  27.18 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.36 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  30.57 
 
 
286 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  47.76 
 
 
102 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  32.62 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.11 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  41.12 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.11 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  32.26 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  47.76 
 
 
102 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  27.53 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  26.55 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  29.76 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  20.73 
 
 
273 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  31.01 
 
 
274 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  29.94 
 
 
519 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1402  hypothetical protein  31.25 
 
 
388 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.728708 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.38 
 
 
218 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.22 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.78 
 
 
558 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.41 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.65 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  29.38 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.41 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  34.91 
 
 
517 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.86 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  33.05 
 
 
280 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  24.88 
 
 
277 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  28.57 
 
 
274 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  30.65 
 
 
482 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  29.44 
 
 
288 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.34 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  39.08 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  45.31 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>