More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0618 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  100 
 
 		 272 aa  544  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  97.71 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  62.18 
 
 		 276 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  61.45 
 
 		 276 aa  346  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  45.74 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  47.33 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  46.5 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  46.5 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  46.56 
 
 		 269 aa  228  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  45 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  48.95 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  49.17 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  46.03 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  43.32 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  43.45 
 
 		 288 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  42.48 
 
 		 279 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.8 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  41.3 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  44.53 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  40.86 
 
 		 279 aa  192  7e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  43.28 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  37.28 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.1 
 
 		 285 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  43.21 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  37.23 
 
 		 272 aa  182  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  38.15 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  40.8 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  42.56 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  35.89 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  34.42 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  38.08 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  40.91 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  37.25 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  38.95 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  37.92 
 
 		 271 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  41.32 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  37.05 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  40.08 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  37.22 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  37.31 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  36.23 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  34.2 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  39.42 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  37.37 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  36.43 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  36.07 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  37.82 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  37.55 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  36.16 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  36.73 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  35.79 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  35.34 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  35.89 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  37.05 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  34.44 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  35.87 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  35.92 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  37.3 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  33.96 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2840  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.14 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  34.98 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  34.08 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  35.37 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  38.02 
 
 		 293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.47 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  34.92 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  34.33 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35.22 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35.14 
 
 		 300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  35.21 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  31.49 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  30.51 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  34.85 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1881  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.7 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  34.34 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  35.51 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  32.14 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  37.34 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  37.63 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  36.51 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  36.51 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  33.85 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  36.46 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  36.8 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  29.48 
 
 		 558 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  34.85 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  34.43 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  34.92 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.81 
 
 		 298 aa  138  7.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  34.07 
 
 		 558 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  33.73 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  36.1 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  32.16 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.37 
 
 		 302 aa  131  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  28.47 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  35.36 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4766  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate- binding protein  32.91 
 
 		 267 aa  128  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  31.84 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>