More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4359 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 558 aa  1112    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  47.63 
 
 		 460 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  45.13 
 
 		 734 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  46.15 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  46.65 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  44.79 
 
 		 562 aa  340  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  42.72 
 
 		 482 aa  340  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  43.94 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  44.44 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 435 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  44.26 
 
 		 435 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  43.68 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  42.59 
 
 		 464 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  43.58 
 
 		 465 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  44.26 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  31.32 
 
 		 517 aa  191  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  32.97 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  32.6 
 
 		 512 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  29.12 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  31.66 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  31.43 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.5 
 
 		 268 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  35.24 
 
 		 271 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  34.96 
 
 		 218 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  35.24 
 
 		 290 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  39.02 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  36.96 
 
 		 271 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  34.8 
 
 		 272 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.07 
 
 		 272 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  33.77 
 
 		 278 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  33.92 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  33.94 
 
 		 270 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  34.51 
 
 		 264 aa  128  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  35.92 
 
 		 267 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  30.04 
 
 		 285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  30.3 
 
 		 284 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  33.78 
 
 		 303 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  33.82 
 
 		 287 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  34.36 
 
 		 272 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  34.08 
 
 		 270 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  33.18 
 
 		 270 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  36.71 
 
 		 284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.23 
 
 		 285 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  33.04 
 
 		 381 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  31.86 
 
 		 272 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  34.13 
 
 		 285 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  30.67 
 
 		 272 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  30.36 
 
 		 272 aa  120  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  36.1 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  30.18 
 
 		 279 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  34.44 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  31.54 
 
 		 269 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  32.74 
 
 		 283 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  33.17 
 
 		 301 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  32.56 
 
 		 272 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  37.65 
 
 		 278 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  30.32 
 
 		 281 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.78 
 
 		 278 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  33.48 
 
 		 284 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  31.22 
 
 		 281 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.21 
 
 		 269 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  35.88 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  35.26 
 
 		 276 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.28 
 
 		 276 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  34.82 
 
 		 272 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  34.29 
 
 		 277 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  33.19 
 
 		 273 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  34.38 
 
 		 272 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  29.75 
 
 		 288 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  25.45 
 
 		 273 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  31.72 
 
 		 281 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  31.56 
 
 		 277 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  29.02 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  34.38 
 
 		 272 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  32.12 
 
 		 558 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  32.38 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  30.84 
 
 		 276 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  32.73 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  26.7 
 
 		 279 aa  108  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  29.91 
 
 		 263 aa  107  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.24 
 
 		 299 aa  107  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 273 aa  107  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  31.78 
 
 		 274 aa  106  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  31.12 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  31.22 
 
 		 273 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  26.96 
 
 		 273 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  31.76 
 
 		 273 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  30.42 
 
 		 323 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  30.83 
 
 		 320 aa  103  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  26.88 
 
 		 274 aa  103  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 274 aa  103  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  31.19 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  31.37 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  30.67 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  30.67 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  28.82 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  34.22 
 
 		 328 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  29 
 
 		 270 aa  99.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  28.63 
 
 		 274 aa  99.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>