More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1147 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  100 
 
 
263 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  38.31 
 
 
267 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  34.63 
 
 
282 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  35.37 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  34.15 
 
 
278 aa  139  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  31.71 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  33.6 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  29.84 
 
 
272 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  33.47 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  33.33 
 
 
270 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  31.56 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  30.95 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  29.67 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  30.12 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  31.4 
 
 
281 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  31.33 
 
 
272 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  30.68 
 
 
272 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  30.68 
 
 
272 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.53 
 
 
277 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  30.74 
 
 
281 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  31.12 
 
 
283 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  30.23 
 
 
279 aa  123  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  28.4 
 
 
268 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  31.82 
 
 
381 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  29.67 
 
 
287 aa  122  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  29.96 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  33.6 
 
 
278 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  30.83 
 
 
298 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  30.04 
 
 
285 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  29.55 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.54 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  31.3 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  30.61 
 
 
272 aa  112  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  28.69 
 
 
279 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.27 
 
 
272 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  32.68 
 
 
273 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.41 
 
 
276 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  30.4 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  27.97 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  29.92 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  30.53 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  27.03 
 
 
276 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.23 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  28.46 
 
 
296 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.8 
 
 
299 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.47 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.35 
 
 
301 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  31.23 
 
 
292 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  29.91 
 
 
558 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  34.68 
 
 
284 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.17 
 
 
300 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  30.92 
 
 
290 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28 
 
 
218 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
273 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  34.3 
 
 
280 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  29.96 
 
 
264 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  28.46 
 
 
270 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  29.62 
 
 
272 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  27.2 
 
 
290 aa  102  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  25.2 
 
 
284 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.06 
 
 
291 aa  102  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  28.57 
 
 
482 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  29.2 
 
 
294 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  30.08 
 
 
276 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  27.59 
 
 
273 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  33.14 
 
 
292 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  27.97 
 
 
330 aa  98.6  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  28.4 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  23.53 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.32 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.39 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.3 
 
 
298 aa  95.5  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  29.8 
 
 
270 aa  95.5  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  28.4 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  28.74 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  26.4 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.68 
 
 
300 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  23.77 
 
 
734 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  24.44 
 
 
558 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  29.32 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  25.64 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  28.95 
 
 
307 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  27.2 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  30.52 
 
 
332 aa  92.4  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  29.41 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  26.07 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  25.29 
 
 
299 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.29 
 
 
308 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.29 
 
 
308 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.29 
 
 
308 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.87 
 
 
331 aa  90.5  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  26.17 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  27.2 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1882  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.9 
 
 
298 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.628761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.63 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.63 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.63 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  27.27 
 
 
562 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.53 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>