More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1776 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  100 
 
 
290 aa  591  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  80.88 
 
 
272 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  76.31 
 
 
290 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  74.44 
 
 
271 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  68.38 
 
 
272 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  68.46 
 
 
271 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  64.21 
 
 
272 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  67.34 
 
 
264 aa  350  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  61.48 
 
 
270 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  67.36 
 
 
276 aa  328  8e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  40.45 
 
 
277 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  43.96 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  43.02 
 
 
267 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  44.81 
 
 
270 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  42.59 
 
 
273 aa  205  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  42.58 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  41.3 
 
 
278 aa  199  6e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  38.43 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  43.43 
 
 
303 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  43.15 
 
 
272 aa  185  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  39.71 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  38.35 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  37.87 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  38.19 
 
 
284 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  37.1 
 
 
299 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  38.74 
 
 
301 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  40.52 
 
 
271 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  40.44 
 
 
278 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  36.33 
 
 
273 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  40.49 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  41.8 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.08 
 
 
272 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.9 
 
 
278 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.65 
 
 
285 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  38.43 
 
 
381 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  38.6 
 
 
285 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  36.69 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  36.3 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.59 
 
 
276 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  40.3 
 
 
330 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  37.86 
 
 
281 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  37.45 
 
 
281 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  33.82 
 
 
268 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  35.38 
 
 
273 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 
273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  39.09 
 
 
218 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  37.24 
 
 
272 aa  155  9e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  36.56 
 
 
294 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  38.4 
 
 
270 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  40.38 
 
 
328 aa  152  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  37.45 
 
 
281 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.85 
 
 
269 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  37.2 
 
 
287 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  38.43 
 
 
302 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  34.55 
 
 
269 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  35.16 
 
 
307 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  33.81 
 
 
277 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  39.27 
 
 
272 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  36.63 
 
 
279 aa  149  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  39.27 
 
 
272 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  33.73 
 
 
273 aa  149  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  39.18 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  33.09 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  33.82 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  40.21 
 
 
292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  36.05 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  32.37 
 
 
274 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.05 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.49 
 
 
291 aa  138  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  32.28 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.06 
 
 
277 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  33.82 
 
 
281 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  37.63 
 
 
278 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.6 
 
 
302 aa  136  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  32.81 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  33.2 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  32.98 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  35.17 
 
 
692 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  33.92 
 
 
558 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.06 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  32.07 
 
 
482 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  29.56 
 
 
558 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  32.28 
 
 
281 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  32.4 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.25 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  31.07 
 
 
288 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  37.95 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  30.91 
 
 
338 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.59 
 
 
278 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  30.92 
 
 
296 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  32.66 
 
 
285 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  31.86 
 
 
444 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  33.48 
 
 
460 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  30.97 
 
 
465 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  33.88 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 
519 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  30.28 
 
 
290 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  30.53 
 
 
464 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.89 
 
 
293 aa  119  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>