More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1062 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  64.91 
 
 		 270 aa  338  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  57.03 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  55.73 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  49.62 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  49.62 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  45.15 
 
 		 273 aa  218  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  43.02 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  45.31 
 
 		 301 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  41.98 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  41.44 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  40.91 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  44.49 
 
 		 271 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  40.3 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  44.35 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  41.06 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  41.83 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  43.1 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  41.8 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  41.73 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  42.17 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  37.83 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  38.75 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  41.7 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  41.6 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.15 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  40.49 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  40.75 
 
 		 285 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  38.31 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  39.27 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  41.2 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.91 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  41.53 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  40.16 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  41.13 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  41.2 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  39.62 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  38.11 
 
 		 284 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  41.46 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  41.8 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  38.55 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  37.66 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  34.93 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  37 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  37.05 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  36.78 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  38.41 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  41.44 
 
 		 218 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  39.75 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  36.33 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35.29 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  41.6 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  39.75 
 
 		 279 aa  161  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  40.5 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  40.08 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  39.51 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  34.44 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  34.72 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  34.29 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  36.18 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  39.59 
 
 		 294 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  38.85 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.94 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  33.57 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  34.8 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  34.69 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.7 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  33.22 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  36.06 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.37 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  34.59 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.55 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  32.85 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  34.55 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  34.89 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.71 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.21 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.96 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  34.16 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  35.6 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  35.69 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.7 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  35.29 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  34.94 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  32.95 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  34.41 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 558 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.33 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.14 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  36.03 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  31.82 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.06 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  33.33 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.33 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.33 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  33.73 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2676  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  35.58 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0612561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>