More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0138 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  100 
 
 
278 aa  560  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  91.73 
 
 
285 aa  482  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  88.49 
 
 
284 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  46.57 
 
 
283 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  46.43 
 
 
284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  49.43 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  49 
 
 
381 aa  238  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  46.86 
 
 
279 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  44.08 
 
 
278 aa  206  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  41.39 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  42.12 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  39.71 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  43.58 
 
 
299 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  43.28 
 
 
272 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  41.03 
 
 
281 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  42.4 
 
 
273 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  41.91 
 
 
272 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  42.8 
 
 
273 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  42.08 
 
 
270 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  43.03 
 
 
281 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  36.46 
 
 
279 aa  185  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  40.4 
 
 
271 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  43.32 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  42.74 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  40.34 
 
 
276 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  41.83 
 
 
272 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  42.06 
 
 
303 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.17 
 
 
276 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  41.9 
 
 
290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  42.08 
 
 
272 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  42.11 
 
 
271 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  40.81 
 
 
287 aa  178  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  40.8 
 
 
273 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  42.04 
 
 
278 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  40.25 
 
 
276 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  39.43 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  37.81 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  40 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  40.49 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  40.66 
 
 
264 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  37.59 
 
 
296 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  37.89 
 
 
298 aa  168  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  37.5 
 
 
292 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  40.56 
 
 
270 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  41.98 
 
 
292 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  40.5 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  40.73 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  36.18 
 
 
301 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  33.33 
 
 
303 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  37.14 
 
 
277 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  38.98 
 
 
307 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  39.62 
 
 
274 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  36.22 
 
 
273 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  37.6 
 
 
271 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  34.55 
 
 
267 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  39.84 
 
 
280 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  37.3 
 
 
277 aa  158  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  38.49 
 
 
272 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  35.68 
 
 
290 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  35.89 
 
 
281 aa  155  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  38.4 
 
 
269 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  36.8 
 
 
278 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  38.96 
 
 
285 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  35.89 
 
 
274 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  34.28 
 
 
299 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  33.33 
 
 
306 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  37.14 
 
 
302 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  36.59 
 
 
291 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  33.92 
 
 
304 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  37.92 
 
 
270 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  37.59 
 
 
285 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.92 
 
 
308 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.92 
 
 
308 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.92 
 
 
308 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.92 
 
 
299 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.92 
 
 
299 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.92 
 
 
299 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2295  phosphate-binding protein  33.68 
 
 
304 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35.93 
 
 
300 aa  148  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  36.82 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  35.66 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  38.03 
 
 
261 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  37.75 
 
 
288 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.1 
 
 
300 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.33 
 
 
331 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.01 
 
 
278 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.96 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  37.85 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.1 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.92 
 
 
286 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  36.69 
 
 
272 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35.71 
 
 
298 aa  138  7.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  36.29 
 
 
272 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  36.29 
 
 
272 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  34.27 
 
 
278 aa  135  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  39.25 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  38.68 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  34.02 
 
 
277 aa  132  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  32.63 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>