More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1620 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  70.9 
 
 
270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  67.28 
 
 
272 aa  378  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  74.39 
 
 
276 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  66.91 
 
 
272 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  71.54 
 
 
290 aa  371  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  69.32 
 
 
264 aa  368  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  70.9 
 
 
271 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  64.21 
 
 
290 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  65.27 
 
 
271 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  40.37 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  47.76 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  43.13 
 
 
282 aa  205  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  42.86 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  34.69 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  40.91 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  44.66 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  41.37 
 
 
278 aa  195  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  37.1 
 
 
283 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  41.84 
 
 
381 aa  185  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  41.43 
 
 
284 aa  185  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  41.53 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  42.75 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.91 
 
 
278 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.74 
 
 
285 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  40.15 
 
 
278 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  40.49 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  42.74 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  40.24 
 
 
303 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  42.8 
 
 
330 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.42 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  38.71 
 
 
285 aa  172  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  40.57 
 
 
281 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  37.99 
 
 
299 aa  171  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  35.76 
 
 
284 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.31 
 
 
277 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  38.93 
 
 
281 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  33.46 
 
 
279 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  39.34 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  36.89 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  37.41 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  37.78 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  36.43 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  37.41 
 
 
273 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  35.07 
 
 
273 aa  161  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  39.34 
 
 
281 aa  161  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.43 
 
 
276 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  38.43 
 
 
276 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  36.36 
 
 
270 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.85 
 
 
269 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  38.46 
 
 
272 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  38.46 
 
 
272 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  37.76 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  41.3 
 
 
332 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  35 
 
 
218 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  37.99 
 
 
278 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  38.68 
 
 
272 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  36.86 
 
 
302 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  33.21 
 
 
278 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  35.2 
 
 
281 aa  149  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  36.07 
 
 
294 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  34.67 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  36.68 
 
 
328 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  32.62 
 
 
274 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  38.97 
 
 
281 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  33.94 
 
 
269 aa  142  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  39.69 
 
 
292 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  36.29 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  33.45 
 
 
274 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  30.91 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4766  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate- binding protein  32.22 
 
 
267 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  38.17 
 
 
280 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  33.72 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  29.6 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  32.02 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  32.51 
 
 
303 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.91 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  35.53 
 
 
692 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 
268 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  30.29 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  32.36 
 
 
274 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  33.61 
 
 
482 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  31.47 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.31 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.79 
 
 
302 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  31.45 
 
 
298 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.35 
 
 
342 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  33.88 
 
 
285 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.96 
 
 
291 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  33.19 
 
 
447 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.47 
 
 
286 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 
519 aa  122  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
435 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  32 
 
 
558 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  32.9 
 
 
428 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
435 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  28.82 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  33.05 
 
 
339 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  32.26 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>