More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1778 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  55.85 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  48.45 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  46.22 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  48.05 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  45.31 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  47.64 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  46.61 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  42.24 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  46.22 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  46.59 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  42.97 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  41.61 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  43.68 
 
 		 272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  41.24 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  45.77 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  37.29 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  45.85 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  45.04 
 
 		 381 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  41.47 
 
 		 271 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  45.9 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  41.53 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  36.54 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  40.32 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  40.96 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  39.15 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  38.74 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  39.53 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  42.51 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  41.41 
 
 		 278 aa  192  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  39.13 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  38.74 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  40 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  39.14 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  40.8 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  37.8 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  40.24 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  40.74 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  40.13 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.37 
 
 		 272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  45.04 
 
 		 274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  38.62 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  38.03 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  36.96 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  38.72 
 
 		 273 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  36.86 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  34.11 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  36.63 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.78 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.09 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  31.99 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  36.09 
 
 		 273 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  37.5 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  37.5 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  39.15 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  38.08 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  35.55 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  35.71 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  36.88 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  37.17 
 
 		 278 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  36.36 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  34.56 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  31.88 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  33.86 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.76 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.73 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  36.7 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  36.14 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.03 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  33.88 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  31.79 
 
 		 558 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  40.81 
 
 		 218 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  36.26 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  36.73 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  36.72 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  37.74 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  38 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  34.53 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.92 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  34.1 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  33.54 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  36.55 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  34.48 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.83 
 
 		 278 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  34.1 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  36.98 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  32.95 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  34.22 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  34.1 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  33.96 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  32.7 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  33.72 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  33.72 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  33.72 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  33.72 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  32.14 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  32.7 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>