More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1490 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  100 
 
 
338 aa  686    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  50.16 
 
 
313 aa  308  8e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  55.22 
 
 
331 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  53.19 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  54.89 
 
 
342 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  54.48 
 
 
333 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  50.18 
 
 
692 aa  294  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  53.05 
 
 
339 aa  292  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  52.52 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  51.44 
 
 
333 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  53.26 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  47.72 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  48.59 
 
 
357 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  51.94 
 
 
345 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  44.52 
 
 
338 aa  276  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  50.54 
 
 
326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  41.9 
 
 
361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  45.94 
 
 
376 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  44.29 
 
 
369 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  46.93 
 
 
352 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  48.76 
 
 
318 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  48.06 
 
 
315 aa  255  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  48.15 
 
 
333 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  46.08 
 
 
337 aa  255  9e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  48.66 
 
 
297 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  45.42 
 
 
349 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  45.35 
 
 
341 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  41.75 
 
 
333 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  47.69 
 
 
318 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  47.69 
 
 
318 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  42.86 
 
 
340 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  42.86 
 
 
340 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.49 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  41.13 
 
 
305 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  41.13 
 
 
305 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.78 
 
 
305 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.78 
 
 
305 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  41.94 
 
 
324 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.78 
 
 
305 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  38.49 
 
 
312 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.43 
 
 
305 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  35.48 
 
 
348 aa  229  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  38.76 
 
 
332 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  39.7 
 
 
305 aa  225  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  43.33 
 
 
347 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  43.33 
 
 
347 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.58 
 
 
305 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  39.01 
 
 
302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.22 
 
 
305 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  44.24 
 
 
337 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  43.49 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  41.47 
 
 
669 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  40.16 
 
 
313 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  41.14 
 
 
666 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  40.77 
 
 
329 aa  199  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  36.75 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  37.5 
 
 
376 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  40.7 
 
 
342 aa  196  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.89 
 
 
325 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  40.45 
 
 
651 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  38.25 
 
 
327 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  38.25 
 
 
327 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  34.38 
 
 
340 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  31.21 
 
 
957 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  28.01 
 
 
935 aa  135  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  33.54 
 
 
301 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  32.59 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  36.4 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  29.6 
 
 
804 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  32.47 
 
 
290 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  33.12 
 
 
337 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  30.91 
 
 
290 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  31.37 
 
 
342 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  29.89 
 
 
272 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  30.8 
 
 
271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  31.73 
 
 
272 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  30.16 
 
 
341 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  31.72 
 
 
273 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  32.37 
 
 
353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  31.61 
 
 
346 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  30.07 
 
 
338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  31.79 
 
 
408 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  30.12 
 
 
351 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  31.7 
 
 
284 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  31.06 
 
 
272 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  27.51 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  31.93 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  32.28 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  31.21 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  28.31 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  34.3 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  28.41 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  29.1 
 
 
274 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  30.65 
 
 
323 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  30.84 
 
 
323 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  31.44 
 
 
270 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  31.99 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  28.68 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  31.29 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  30.9 
 
 
323 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>