More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6423 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  100 
 
 
804 aa  1594    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  54.26 
 
 
957 aa  336  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  51.19 
 
 
935 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  35.8 
 
 
315 aa  170  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  34.18 
 
 
318 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  33.33 
 
 
692 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  30.43 
 
 
376 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  32.69 
 
 
631 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  28.4 
 
 
313 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  31.37 
 
 
361 aa  138  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  30.12 
 
 
369 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  32.49 
 
 
632 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  32.24 
 
 
332 aa  135  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.65 
 
 
342 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  32.27 
 
 
651 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  33.96 
 
 
312 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  30.23 
 
 
333 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  33.58 
 
 
326 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  27.38 
 
 
297 aa  127  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  29.6 
 
 
338 aa  127  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  33.46 
 
 
324 aa  125  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  28.1 
 
 
357 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  29.8 
 
 
339 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  28.24 
 
 
340 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  27 
 
 
341 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  28.24 
 
 
340 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  28.97 
 
 
338 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  30.5 
 
 
331 aa  120  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  30.74 
 
 
326 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  31.97 
 
 
337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  29 
 
 
340 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  27.48 
 
 
349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  30.08 
 
 
333 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  29.24 
 
 
880 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  29.07 
 
 
333 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  30.52 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  30.52 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  28.11 
 
 
347 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  28.11 
 
 
347 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  28.4 
 
 
352 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  27.05 
 
 
313 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  28.03 
 
 
334 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  29.34 
 
 
337 aa  112  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  30.52 
 
 
332 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  31.36 
 
 
658 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  29.02 
 
 
345 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.74 
 
 
340 aa  108  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  28.8 
 
 
683 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  28.09 
 
 
333 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.51 
 
 
305 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  28.46 
 
 
302 aa  101  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  27.35 
 
 
305 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.69 
 
 
305 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.69 
 
 
305 aa  98.6  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.69 
 
 
305 aa  98.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  27.91 
 
 
666 aa  98.6  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  30.05 
 
 
329 aa  97.8  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  27.86 
 
 
669 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.35 
 
 
305 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.27 
 
 
305 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.76 
 
 
305 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  28.03 
 
 
861 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  24.04 
 
 
348 aa  92.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.53 
 
 
305 aa  92  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  29.3 
 
 
328 aa  92  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36840  hypothetical protein  29.54 
 
 
446 aa  91.3  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  29.04 
 
 
657 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  24.32 
 
 
612 aa  88.6  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.53 
 
 
305 aa  88.6  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0145  heat shock protein 70  26.03 
 
 
577 aa  87.8  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  25.21 
 
 
616 aa  87  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  24.52 
 
 
620 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  25.09 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  26.77 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  24.73 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  28.11 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  24.12 
 
 
607 aa  82  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  22.72 
 
 
649 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  28.89 
 
 
858 aa  81.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.49 
 
 
325 aa  80.5  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2974  Heat shock protein 70  26.82 
 
 
473 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458744  normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  24.53 
 
 
608 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0378  molecular chaperone DnaK  25.51 
 
 
653 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3115  heat shock protein 70  24.38 
 
 
619 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.157677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  24.27 
 
 
607 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  24.8 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0706  molecular chaperone DnaK  23.97 
 
 
621 aa  80.1  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0162931  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  24.93 
 
 
621 aa  78.6  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  24.66 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0100  chaperone protein DnaK  25.27 
 
 
619 aa  77.8  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.843776  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  24.23 
 
 
596 aa  77.8  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1250  molecular chaperone DnaK  25.26 
 
 
630 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  22.4 
 
 
566 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  24.05 
 
 
600 aa  76.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  22.4 
 
 
566 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  22.4 
 
 
566 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  24.86 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  23.58 
 
 
617 aa  76.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  24.93 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  23.48 
 
 
612 aa  75.5  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>