More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1099 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  100 
 
 
342 aa  690    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  74.11 
 
 
334 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  68.73 
 
 
331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  67.49 
 
 
332 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  68.07 
 
 
339 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  67.69 
 
 
333 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  70.68 
 
 
340 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  66.13 
 
 
326 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  63.93 
 
 
333 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  57.43 
 
 
352 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  58.17 
 
 
333 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  49.57 
 
 
340 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  49.57 
 
 
340 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  58.5 
 
 
338 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  50.15 
 
 
341 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  49.08 
 
 
349 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  53.62 
 
 
361 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  59.55 
 
 
318 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  59.55 
 
 
318 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  56.25 
 
 
337 aa  343  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  54.61 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  50.48 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  55.84 
 
 
692 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  50.95 
 
 
357 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  53.11 
 
 
345 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  48.81 
 
 
347 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  48.81 
 
 
347 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  49.34 
 
 
369 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  54.33 
 
 
337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  51.01 
 
 
313 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  54.89 
 
 
338 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  50 
 
 
333 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  53.62 
 
 
315 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  53.28 
 
 
297 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  48.73 
 
 
318 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  41.69 
 
 
313 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  41.67 
 
 
305 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  41.16 
 
 
302 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.2 
 
 
305 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  43.33 
 
 
312 aa  245  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.49 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  41.49 
 
 
305 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  41.49 
 
 
305 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.13 
 
 
305 aa  242  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.49 
 
 
305 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40 
 
 
305 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  42.64 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.48 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  41.11 
 
 
305 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  43.54 
 
 
324 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  45.05 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  40.81 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  44.33 
 
 
669 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  39.45 
 
 
376 aa  219  7e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  43.62 
 
 
666 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  35.11 
 
 
348 aa  208  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  41.46 
 
 
651 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  41.2 
 
 
329 aa  203  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.78 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  38.66 
 
 
327 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  38.66 
 
 
327 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  35 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  31.99 
 
 
342 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  32.52 
 
 
331 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  29.97 
 
 
935 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  32.33 
 
 
957 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.93 
 
 
331 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.02 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  31.01 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  32.02 
 
 
331 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  29.07 
 
 
804 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  33.55 
 
 
346 aa  132  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  30.86 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  30 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  30.18 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  29.38 
 
 
341 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  33.22 
 
 
341 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  32.98 
 
 
353 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  31.03 
 
 
344 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  32.35 
 
 
272 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  31.07 
 
 
344 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  33.94 
 
 
271 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  30.69 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  33.86 
 
 
271 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  31.6 
 
 
347 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.83 
 
 
342 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  32.51 
 
 
359 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  33.33 
 
 
272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  33.21 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.1 
 
 
348 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  30.48 
 
 
344 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  31.89 
 
 
350 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.81 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.69 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  31.52 
 
 
272 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  31.94 
 
 
351 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  30.42 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  30.31 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  31.85 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  30.26 
 
 
351 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.883019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>