219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0598 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 		 342 aa  695    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  65.93 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  65.12 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  60.83 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  59.38 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  60.06 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  59.12 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  58.92 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  56.47 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  55.26 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  51.41 
 
 		 361 aa  361  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  55.15 
 
 		 337 aa  352  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  53.58 
 
 		 342 aa  349  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  54.46 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  51.63 
 
 		 342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  50.59 
 
 		 346 aa  335  5e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  48.4 
 
 		 346 aa  329  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  51.04 
 
 		 338 aa  328  9e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  49.56 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  50.73 
 
 		 353 aa  318  6e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  50.8 
 
 		 353 aa  317  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  46.36 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  46.36 
 
 		 348 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  43.36 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  48.7 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  45.45 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  43.62 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  46.58 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  46.18 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  44.89 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  46.18 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  44.89 
 
 		 331 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  46.45 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  41.23 
 
 		 344 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  44.92 
 
 		 347 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  43.83 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  42.99 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  43.83 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  43.34 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  46.91 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  43.51 
 
 		 341 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  39.09 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  42.27 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  40.3 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  41.83 
 
 		 338 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40.3 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  38.14 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  37.58 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  32.08 
 
 		 651 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  32.27 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  29.94 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  31.69 
 
 		 318 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  31.69 
 
 		 318 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  28.44 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  28.44 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  34.47 
 
 		 666 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  32.86 
 
 		 669 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  30.43 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  33.1 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  31.14 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  33.46 
 
 		 692 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  30.03 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  30.03 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  29.52 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  28.83 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.86 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.16 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  26.61 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  30.45 
 
 		 345 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  29.82 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.16 
 
 		 305 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  30.12 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  30.54 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  30.72 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  30.14 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.53 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.53 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  28.12 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  28.9 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  29.67 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  29.96 
 
 		 361 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  31.52 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.85 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.95 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.53 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  31.58 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.92 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  30.39 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  28.84 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  29.32 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  27.22 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  28.84 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  30.79 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  28.34 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.17 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  30.97 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  28.01 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  31.36 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  27.54 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  25.64 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>