236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0376 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  100 
 
 
342 aa  700    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  80.99 
 
 
342 aa  586  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  63.13 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  59 
 
 
338 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  56.73 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  61.85 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  57.44 
 
 
346 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  55.02 
 
 
344 aa  339  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  54.49 
 
 
342 aa  338  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  52.96 
 
 
350 aa  338  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  54.09 
 
 
408 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  50.76 
 
 
351 aa  325  7e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  49.52 
 
 
347 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  50 
 
 
351 aa  312  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  48.2 
 
 
349 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  46.18 
 
 
331 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  42.69 
 
 
361 aa  298  6e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  45.57 
 
 
331 aa  296  3e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  45.26 
 
 
331 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  45.95 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  45.45 
 
 
359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  47.24 
 
 
327 aa  276  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  44.83 
 
 
348 aa  268  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  44.25 
 
 
348 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  44.83 
 
 
348 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  43.82 
 
 
353 aa  265  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  43.9 
 
 
347 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  41.18 
 
 
338 aa  261  1e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  45.6 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  43.3 
 
 
344 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  43.75 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  43.61 
 
 
344 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  44.24 
 
 
344 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  44.26 
 
 
347 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40.24 
 
 
344 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  43.21 
 
 
346 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  42.95 
 
 
347 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  42.95 
 
 
347 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  41 
 
 
383 aa  235  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  39 
 
 
338 aa  233  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  42.57 
 
 
342 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  41.85 
 
 
348 aa  231  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  40.26 
 
 
341 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40.57 
 
 
346 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  38.61 
 
 
338 aa  223  3e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  37.04 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  38.74 
 
 
340 aa  217  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  33.44 
 
 
339 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  32.77 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  29.38 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.86 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.57 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  30.74 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  30.74 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  33.89 
 
 
318 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  33.89 
 
 
318 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.26 
 
 
305 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.95 
 
 
305 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.26 
 
 
305 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.26 
 
 
305 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  32.3 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  30.6 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.26 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  33.13 
 
 
331 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  29.87 
 
 
666 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  31.23 
 
 
651 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.95 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  34.55 
 
 
337 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  32.72 
 
 
333 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  31.17 
 
 
339 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.75 
 
 
305 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  28.9 
 
 
669 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  29.94 
 
 
340 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  31.72 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.97 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  29.06 
 
 
326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  32.08 
 
 
337 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  32.5 
 
 
692 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  28.05 
 
 
341 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  29.97 
 
 
361 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  31.27 
 
 
334 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  29.43 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  29.9 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  28.99 
 
 
369 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  28.01 
 
 
333 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  29.45 
 
 
345 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  29.24 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  29.41 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  28.91 
 
 
347 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  28.91 
 
 
347 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  28.95 
 
 
332 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  29.97 
 
 
290 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  29.74 
 
 
357 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  28.38 
 
 
333 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.36 
 
 
340 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  26.76 
 
 
312 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  29.49 
 
 
352 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  31.52 
 
 
274 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  31.35 
 
 
272 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  29.17 
 
 
274 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>