251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0119 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  100 
 
 		 344 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  77.57 
 
 		 344 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  77.57 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  72.59 
 
 		 348 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  76.25 
 
 		 341 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  73.18 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  72.3 
 
 		 348 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  69.21 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  62.73 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  64.07 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  65.35 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  62.57 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  65.79 
 
 		 341 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  62.57 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  55.95 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  57.99 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  48.7 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  45.32 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  43.77 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  44.64 
 
 		 338 aa  275  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  44.94 
 
 		 344 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  42.82 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  43.58 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  43.21 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  42.24 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  42.17 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  43.89 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  44.03 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  44.13 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  42.41 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  39.88 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  42.9 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  41.07 
 
 		 351 aa  245  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  41.3 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  40.12 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  40.76 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  40.72 
 
 		 353 aa  228  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  37.58 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  39.5 
 
 		 353 aa  216  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.59 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  35.65 
 
 		 383 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  36.04 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.37 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  35.12 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.82 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  33.33 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.43 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  31.25 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  28.62 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  32.42 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  28.62 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  31.25 
 
 		 651 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  29.65 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  27.81 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  31.31 
 
 		 666 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.27 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.49 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.28 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.14 
 
 		 305 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  30.28 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.39 
 
 		 305 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  30.51 
 
 		 669 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  28.66 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  29.55 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.69 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.69 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  29.14 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.69 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.24 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  29.39 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  30.48 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  29.37 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  27.22 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.79 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  27.85 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  29.29 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  27.78 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  30.06 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  27.96 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.45 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  28.76 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  27.72 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  30.55 
 
 		 361 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  27.72 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  28.03 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  27.36 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  28.03 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  29.45 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  29.45 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  27.68 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  30.16 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  28.96 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  30.15 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  29.69 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.91 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  25 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  28.66 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  28.33 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  28.38 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  30.08 
 
 		 274 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>