210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3755 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  100 
 
 
347 aa  709    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  69.52 
 
 
408 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  63.32 
 
 
351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  66.46 
 
 
350 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  55.85 
 
 
361 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  62.42 
 
 
344 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  61.99 
 
 
342 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  52.13 
 
 
351 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  56.05 
 
 
349 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  55.66 
 
 
359 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  50.29 
 
 
337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  45.8 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  49.52 
 
 
342 aa  317  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  46.13 
 
 
341 aa  312  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  49.39 
 
 
353 aa  311  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  48.3 
 
 
342 aa  308  9e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  46.25 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  46.95 
 
 
347 aa  305  7e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  47.69 
 
 
344 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  46.31 
 
 
338 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  46.91 
 
 
353 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  44.07 
 
 
383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  42.99 
 
 
338 aa  281  1e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.94 
 
 
348 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.94 
 
 
348 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  39.39 
 
 
339 aa  260  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  40.63 
 
 
340 aa  259  4e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.04 
 
 
348 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  39.81 
 
 
338 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  42.65 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  42.36 
 
 
344 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  42.36 
 
 
331 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  43.09 
 
 
341 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  41.21 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  41.38 
 
 
344 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40.67 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40.67 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  41.38 
 
 
344 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40.46 
 
 
346 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  40.94 
 
 
347 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  41.06 
 
 
327 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.37 
 
 
346 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  37.54 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  38.94 
 
 
341 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  39.87 
 
 
342 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  40.43 
 
 
348 aa  226  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  37.12 
 
 
338 aa  224  2e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  34.08 
 
 
339 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  36.64 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  32.59 
 
 
669 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  34.07 
 
 
666 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  33.33 
 
 
651 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  32 
 
 
692 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  33.79 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  32.54 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  32.54 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  33.03 
 
 
337 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  31.59 
 
 
297 aa  126  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  30.58 
 
 
345 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  33.89 
 
 
340 aa  123  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  31.33 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.6 
 
 
342 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  29.03 
 
 
305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  30.87 
 
 
333 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  32.04 
 
 
331 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  30.18 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  30.11 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.91 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  29.97 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  28.32 
 
 
340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  28.32 
 
 
340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  31.58 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  28.4 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  28.78 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  30.32 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  28.7 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  27.37 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  30.1 
 
 
312 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  29.63 
 
 
361 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  30.25 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.79 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  28.98 
 
 
315 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  31.86 
 
 
338 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  26.73 
 
 
369 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  28 
 
 
333 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  27.62 
 
 
347 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  27.62 
 
 
347 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  30.56 
 
 
329 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  28.98 
 
 
318 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  27.88 
 
 
376 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  32.37 
 
 
334 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  27.56 
 
 
349 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.62 
 
 
305 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.86 
 
 
305 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.56 
 
 
305 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  27 
 
 
333 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.28 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.28 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.81 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  27.24 
 
 
302 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>