144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2035 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  100 
 
 
338 aa  671    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  43.09 
 
 
351 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  39.94 
 
 
347 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  43.09 
 
 
359 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  39.74 
 
 
350 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  41.14 
 
 
342 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  40 
 
 
344 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  42.59 
 
 
351 aa  245  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  40.13 
 
 
349 aa  235  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  38.49 
 
 
342 aa  233  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  36.62 
 
 
361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  37.54 
 
 
408 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  37.58 
 
 
342 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  37 
 
 
346 aa  226  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  39.43 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  38.54 
 
 
337 aa  219  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  37.95 
 
 
341 aa  218  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  39.48 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  37.38 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  39.31 
 
 
353 aa  212  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  34.54 
 
 
338 aa  211  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  36.03 
 
 
338 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  34.47 
 
 
346 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  35.49 
 
 
347 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  35.64 
 
 
344 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  35.31 
 
 
344 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.39 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.89 
 
 
338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  35.43 
 
 
341 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  31.37 
 
 
340 aa  180  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.05 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.05 
 
 
348 aa  179  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.22 
 
 
346 aa  179  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.41 
 
 
348 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.56 
 
 
331 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.83 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  33.22 
 
 
331 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  33.88 
 
 
341 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  32.42 
 
 
331 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  31.02 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.2 
 
 
327 aa  161  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.77 
 
 
348 aa  161  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.89 
 
 
347 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.89 
 
 
347 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.11 
 
 
342 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  31.56 
 
 
347 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  32.12 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  31 
 
 
339 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  31.14 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  34.78 
 
 
666 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  33.73 
 
 
669 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  27.27 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  28.62 
 
 
332 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.74 
 
 
305 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.74 
 
 
305 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  28.99 
 
 
345 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.52 
 
 
342 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  26.48 
 
 
338 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  29.33 
 
 
651 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.41 
 
 
305 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  29.2 
 
 
340 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.74 
 
 
305 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  27.96 
 
 
305 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.41 
 
 
305 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.08 
 
 
305 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.41 
 
 
305 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.42 
 
 
305 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  27.21 
 
 
369 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  27.8 
 
 
333 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.08 
 
 
305 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  27.55 
 
 
376 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  27.57 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  26.69 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  26.69 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  30.8 
 
 
692 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  27.76 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  27.39 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  28.52 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  25.08 
 
 
352 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  25.4 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  27.78 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  28.32 
 
 
333 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  27.36 
 
 
376 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  30.38 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.8 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  25.67 
 
 
333 aa  92.8  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  25.65 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  27.84 
 
 
338 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  26.69 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  28.25 
 
 
318 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  26.54 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  28.25 
 
 
318 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  27.27 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  23.57 
 
 
333 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  25.83 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  28.39 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  26.01 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  26.06 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  26.06 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  26.07 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>