More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3610 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  100 
 
 
376 aa  761    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  72.61 
 
 
369 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  57.07 
 
 
361 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  57.1 
 
 
357 aa  381  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  53.47 
 
 
692 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  52.09 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  50.48 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  49.83 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  48.52 
 
 
339 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  48.03 
 
 
333 aa  309  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  46.71 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  51.51 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  48.85 
 
 
345 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  50.93 
 
 
313 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  47.84 
 
 
333 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  46.47 
 
 
333 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  47.04 
 
 
334 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  45.87 
 
 
349 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  46.86 
 
 
326 aa  292  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  46.05 
 
 
341 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  46.38 
 
 
340 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  46.38 
 
 
340 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  44.22 
 
 
352 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  46.53 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  48.84 
 
 
337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  45.94 
 
 
338 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  50.94 
 
 
318 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  50.19 
 
 
297 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  46.58 
 
 
318 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  46.58 
 
 
318 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  45.67 
 
 
337 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  40.48 
 
 
347 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  40.48 
 
 
347 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  48.68 
 
 
315 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  44.28 
 
 
313 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  40.75 
 
 
333 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  44.74 
 
 
312 aa  245  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  39.71 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  40.89 
 
 
302 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  40.89 
 
 
305 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.89 
 
 
305 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  40.89 
 
 
305 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.89 
 
 
305 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.52 
 
 
305 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.52 
 
 
305 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.89 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  44.11 
 
 
324 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.26 
 
 
305 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.26 
 
 
305 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  45.15 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  39.39 
 
 
332 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  37.5 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  40.3 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  37.2 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.73 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  36.4 
 
 
328 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  40.85 
 
 
669 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  40.49 
 
 
666 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  34.77 
 
 
651 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  36.23 
 
 
327 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  36.23 
 
 
327 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  35.33 
 
 
340 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  32.38 
 
 
935 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  30.32 
 
 
957 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  33.33 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  30.36 
 
 
804 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  29.79 
 
 
346 aa  123  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.38 
 
 
331 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  32.26 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.67 
 
 
327 aa  120  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  30.6 
 
 
353 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  30.94 
 
 
274 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.9 
 
 
342 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  31.2 
 
 
273 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  32.03 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  30.19 
 
 
274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  29.51 
 
 
344 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  30.18 
 
 
341 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  27.74 
 
 
341 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  29.51 
 
 
344 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  29.55 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  29.66 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  27.99 
 
 
338 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.07 
 
 
347 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  32.16 
 
 
271 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.72 
 
 
347 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.46 
 
 
301 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  34.63 
 
 
285 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  27.67 
 
 
361 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  30.9 
 
 
347 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  28.16 
 
 
337 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  27.84 
 
 
350 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  29.43 
 
 
347 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  27.99 
 
 
346 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  30.29 
 
 
353 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  27.88 
 
 
347 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.18 
 
 
408 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  28.38 
 
 
342 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  28.34 
 
 
342 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  29.82 
 
 
359 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>