More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4077 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  100 
 
 		 313 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  43.52 
 
 		 341 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  44.67 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  47.41 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  42.58 
 
 		 339 aa  278  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  43.14 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  45.09 
 
 		 352 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  46.74 
 
 		 357 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  43.99 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  43.99 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  45.94 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  41.69 
 
 		 342 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  44.28 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  44.29 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  45.62 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  44.01 
 
 		 692 aa  257  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  38.93 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  38.93 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  42.5 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  39.54 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  41.58 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  44.19 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  41.75 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  42.22 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  37.7 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  41.22 
 
 		 331 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  40.58 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  41.15 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  40.94 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  39.46 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  40.73 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  33.45 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  37.54 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  40.16 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  39.63 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  39.63 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  36.88 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  40.15 
 
 		 666 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  38.38 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  39.05 
 
 		 669 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.69 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  33.69 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  33.11 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  34.29 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.14 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.69 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  38.85 
 
 		 376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.49 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.49 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.49 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.17 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.49 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.17 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  38.89 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  36.4 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  32.76 
 
 		 348 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  32.86 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.27 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  35.83 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  30.39 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  30.39 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  33.56 
 
 		 651 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  32.2 
 
 		 935 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  30.08 
 
 		 957 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  27.88 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  27.04 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  28.78 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  30.77 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  30.33 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  27.05 
 
 		 804 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  30.41 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  28.45 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.27 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  30.65 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  30.61 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  29.79 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  28.71 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  26.96 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  31.71 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 359 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  26.92 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  30.43 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  25.72 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  27.97 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.28 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  29.39 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  27.97 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  26.43 
 
 		 353 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  30.12 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  25.23 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  25.3 
 
 		 408 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  26.76 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  26.91 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.64 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  26.96 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  25.49 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  26.07 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>