More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2488 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  100 
 
 
331 aa  675    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  87.5 
 
 
333 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  74.76 
 
 
334 aa  488  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  68.73 
 
 
342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  67.18 
 
 
332 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  66.67 
 
 
326 aa  447  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  65.24 
 
 
339 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  66.45 
 
 
340 aa  425  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  58.82 
 
 
333 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  54.46 
 
 
352 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  51.79 
 
 
333 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  49.7 
 
 
341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  49.34 
 
 
361 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  53.07 
 
 
338 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  49.09 
 
 
349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  50.32 
 
 
357 aa  325  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  55.48 
 
 
318 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  55.48 
 
 
318 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  52.1 
 
 
337 aa  323  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  50.49 
 
 
340 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  50.49 
 
 
340 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  52.3 
 
 
692 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  46.71 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  55.22 
 
 
338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  51.31 
 
 
337 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  46.23 
 
 
345 aa  298  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  47.7 
 
 
340 aa  294  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  47.57 
 
 
347 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  47.57 
 
 
347 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  49.18 
 
 
313 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  43.93 
 
 
369 aa  291  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  47.04 
 
 
333 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  51.33 
 
 
297 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  51.89 
 
 
315 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  50.76 
 
 
318 aa  248  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  41.22 
 
 
313 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  40.57 
 
 
305 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  40.21 
 
 
302 aa  228  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  38.61 
 
 
305 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  41.24 
 
 
312 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.86 
 
 
305 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  39.86 
 
 
305 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  39.86 
 
 
305 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.5 
 
 
305 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.86 
 
 
305 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.5 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.72 
 
 
305 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  43.84 
 
 
669 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  40.28 
 
 
324 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.37 
 
 
305 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  43.77 
 
 
326 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  43.49 
 
 
666 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  37.55 
 
 
332 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  34.56 
 
 
348 aa  202  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  39.78 
 
 
328 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  38.15 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  44.32 
 
 
651 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  38.91 
 
 
329 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.33 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  34.53 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  34.53 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  32.29 
 
 
342 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  34.29 
 
 
340 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  31.75 
 
 
935 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  33.94 
 
 
331 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.86 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  31.9 
 
 
957 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.13 
 
 
331 aa  139  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  33.94 
 
 
331 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  33.33 
 
 
346 aa  135  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  32.68 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  31.58 
 
 
338 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  33.13 
 
 
342 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  31.56 
 
 
353 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  30.77 
 
 
342 aa  123  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  31.74 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  31.23 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  30.5 
 
 
804 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  33.45 
 
 
341 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  31.4 
 
 
344 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  32.28 
 
 
271 aa  119  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  32.04 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.97 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.56 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  31.4 
 
 
351 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  30.35 
 
 
344 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  32.22 
 
 
271 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  27.15 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  29.63 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  30.82 
 
 
353 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  31.21 
 
 
350 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  31.06 
 
 
272 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.77 
 
 
348 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  29.41 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  29.31 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.77 
 
 
348 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.45 
 
 
348 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  27.12 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  30.29 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  28.47 
 
 
270 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>