More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3562 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  100 
 
 		 333 aa  680    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  87.5 
 
 		 331 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  76.92 
 
 		 334 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  67.17 
 
 		 332 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  67.69 
 
 		 342 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  69.84 
 
 		 326 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  66.67 
 
 		 339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  65.81 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  60.86 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  55.63 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  52.56 
 
 		 333 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  51.67 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  50.6 
 
 		 341 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  51.64 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  52.63 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  57.23 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  57.23 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  51.52 
 
 		 338 aa  332  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  54.61 
 
 		 692 aa  332  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  52.13 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  52.13 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  50.9 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  48.03 
 
 		 376 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  51.96 
 
 		 337 aa  308  8e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  49.18 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  49.19 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  49.19 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  54.48 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  47.44 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  45.07 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  52.65 
 
 		 313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  43.17 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  51.52 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  50.95 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  52.27 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  41.75 
 
 		 313 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  41.61 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  39.15 
 
 		 302 aa  222  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  38.21 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  41.45 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.15 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  44.93 
 
 		 669 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.43 
 
 		 305 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  38.43 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  38.43 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  43.82 
 
 		 666 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.08 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.43 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.08 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  36.91 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  38.08 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  43.06 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  38.87 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.72 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  37.24 
 
 		 376 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  45.08 
 
 		 651 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  36.17 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  39.27 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.61 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  33.8 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  33.45 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  33.45 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  35.44 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  34.05 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.83 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  33.09 
 
 		 935 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.33 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  34.83 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  31.25 
 
 		 957 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  33.66 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  34.38 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  31.58 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  32.72 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  31.12 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  31.21 
 
 		 353 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  30.87 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  32.65 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  31.67 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  30.4 
 
 		 341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.65 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  33.45 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  30.85 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  29.07 
 
 		 804 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  31.85 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  30.19 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  30.34 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  31.49 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.79 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  30 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  29.38 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  26.39 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  30.13 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.48 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.17 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  30.04 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  27.95 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  30.9 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  29.15 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  29.86 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  30.56 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>