More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3003 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  100 
 
 
935 aa  1828    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  57.06 
 
 
957 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  51.19 
 
 
804 aa  320  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  35.29 
 
 
632 aa  174  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  34.67 
 
 
631 aa  168  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  34.25 
 
 
376 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  34.74 
 
 
361 aa  166  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  34.04 
 
 
315 aa  161  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  32.23 
 
 
683 aa  157  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  32.64 
 
 
357 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  32.3 
 
 
369 aa  156  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  34.94 
 
 
318 aa  156  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  33.33 
 
 
332 aa  153  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  35.64 
 
 
326 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  31.85 
 
 
324 aa  152  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  34.07 
 
 
312 aa  151  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  34.48 
 
 
692 aa  151  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  31.01 
 
 
313 aa  151  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  31.32 
 
 
338 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  31.75 
 
 
331 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.17 
 
 
342 aa  148  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  30.42 
 
 
880 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  31.21 
 
 
333 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  34.31 
 
 
349 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  33.09 
 
 
333 aa  145  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  32.83 
 
 
340 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  32.83 
 
 
340 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  30.1 
 
 
339 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  31.56 
 
 
297 aa  140  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  30.1 
 
 
340 aa  138  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  32.2 
 
 
313 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  35.19 
 
 
326 aa  137  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  28.26 
 
 
338 aa  137  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  31.4 
 
 
347 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  31.4 
 
 
347 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  31.71 
 
 
334 aa  135  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  28.79 
 
 
352 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  32.48 
 
 
337 aa  133  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  32.51 
 
 
658 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  30.45 
 
 
341 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  30.97 
 
 
333 aa  127  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  31.84 
 
 
657 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  30.53 
 
 
318 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  30.53 
 
 
318 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.39 
 
 
305 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  28.57 
 
 
608 aa  122  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1798  molecular chaperone DnaK  27.2 
 
 
616 aa  121  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  27.12 
 
 
607 aa  120  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  27.89 
 
 
610 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  28.57 
 
 
332 aa  120  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl415  molecular chaperone DnaK  27.37 
 
 
592 aa  118  6e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.847356  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0369  molecular chaperone DnaK  29.32 
 
 
591 aa  118  6e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  27.6 
 
 
612 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.32 
 
 
305 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  27.86 
 
 
609 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.32 
 
 
305 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  26.61 
 
 
600 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.32 
 
 
305 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  29.56 
 
 
611 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  29.24 
 
 
337 aa  115  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  27.95 
 
 
607 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  29.56 
 
 
611 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  27.81 
 
 
621 aa  115  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  29.91 
 
 
380 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.67 
 
 
305 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  28.97 
 
 
609 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  28.69 
 
 
615 aa  115  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.68 
 
 
340 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  26.1 
 
 
610 aa  114  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0145  heat shock protein 70  28.77 
 
 
577 aa  114  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  28.83 
 
 
302 aa  114  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  25.77 
 
 
637 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.83 
 
 
305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4793  chaperone protein DnaK  28.57 
 
 
637 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126797  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  26.23 
 
 
621 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1181  molecular chaperone, DnaK family  25.77 
 
 
636 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0502129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.96 
 
 
305 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  27.45 
 
 
617 aa  113  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36840  hypothetical protein  31.3 
 
 
446 aa  112  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  31.18 
 
 
329 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  27.7 
 
 
305 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3460  chaperone protein DnaK  29.12 
 
 
612 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0706  molecular chaperone DnaK  27.76 
 
 
621 aa  111  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0162931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0440  chaperone protein DnaK  28.05 
 
 
618 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00195865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  28.73 
 
 
611 aa  111  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  28.25 
 
 
619 aa  111  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  27.11 
 
 
644 aa  111  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  27.11 
 
 
644 aa  111  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  25.52 
 
 
636 aa  111  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  27.5 
 
 
609 aa  111  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  28.21 
 
 
620 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  26.79 
 
 
635 aa  110  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0822  molecular chaperone DnaK  27.6 
 
 
623 aa  110  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.762106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  29.28 
 
 
611 aa  110  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  29.28 
 
 
611 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  29.28 
 
 
611 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  29.28 
 
 
611 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  29.28 
 
 
611 aa  110  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  27.98 
 
 
610 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  27.98 
 
 
610 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>