More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1829 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  100 
 
 
338 aa  691    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  57.61 
 
 
361 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  59.42 
 
 
333 aa  358  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  58.5 
 
 
342 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  59.04 
 
 
692 aa  352  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  54.63 
 
 
339 aa  351  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  48.95 
 
 
340 aa  347  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  52.09 
 
 
376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  54.34 
 
 
352 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  51.38 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  52.41 
 
 
357 aa  335  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  56.17 
 
 
334 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  53.07 
 
 
331 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  51.52 
 
 
333 aa  332  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  54.72 
 
 
345 aa  328  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  55.26 
 
 
340 aa  325  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  50.61 
 
 
340 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  50.61 
 
 
340 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  53.02 
 
 
333 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  49.52 
 
 
369 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  52.08 
 
 
326 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  50.16 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  47.75 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  49.38 
 
 
341 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  46.81 
 
 
347 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  46.81 
 
 
347 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  49.24 
 
 
337 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  54.21 
 
 
297 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  51.12 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  51.12 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  50.15 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  44.52 
 
 
338 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  52.57 
 
 
315 aa  275  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  50.74 
 
 
318 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  46.43 
 
 
312 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  44.49 
 
 
302 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  44.57 
 
 
305 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  44.12 
 
 
305 aa  255  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  42.31 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  43.84 
 
 
305 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  43.48 
 
 
305 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  43.84 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  43.84 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  43.84 
 
 
305 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  43.84 
 
 
305 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0848  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  43.68 
 
 
305 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  45 
 
 
326 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  41.58 
 
 
313 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4388  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.96 
 
 
305 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  43.56 
 
 
324 aa  239  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0502  phosphate binding protein  45.76 
 
 
329 aa  225  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.940111  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0357  phosphate binding protein  40.14 
 
 
376 aa  216  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129882  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0494  phosphate binding protein  39.46 
 
 
348 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  38.85 
 
 
332 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3447  phosphate binding protein  38.65 
 
 
328 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  40.62 
 
 
669 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  40.31 
 
 
651 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  39.93 
 
 
666 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.74 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  32.89 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  32.89 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2358  ABC transporter periplasmic phosphate-binding protein  35.93 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  31.08 
 
 
340 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  32.01 
 
 
957 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  31.32 
 
 
935 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  35.09 
 
 
285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  32.32 
 
 
290 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  31.12 
 
 
272 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  30.94 
 
 
331 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  31.06 
 
 
271 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.94 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  28.97 
 
 
804 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  30 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  33.33 
 
 
330 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  30.53 
 
 
272 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  30.15 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  34.44 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  33.46 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  30.82 
 
 
338 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  30.21 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.96 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  30.6 
 
 
290 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  30.62 
 
 
331 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  29.06 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  31.46 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  29.97 
 
 
285 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  31.06 
 
 
272 aa  113  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  29.49 
 
 
274 aa  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  28.7 
 
 
347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  28 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  28.2 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  28.52 
 
 
283 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  29.29 
 
 
342 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.08 
 
 
268 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  26.12 
 
 
274 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.3 
 
 
285 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.86 
 
 
272 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  29.29 
 
 
353 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  30.22 
 
 
302 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  30.38 
 
 
284 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>