More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1946 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  100 
 
 
957 aa  1882    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  52 
 
 
935 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  53.92 
 
 
804 aa  337  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  39.21 
 
 
631 aa  206  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  32.34 
 
 
361 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  37.64 
 
 
315 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  36.26 
 
 
318 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  30.28 
 
 
313 aa  159  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  30.61 
 
 
376 aa  159  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  34.94 
 
 
880 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  32.01 
 
 
338 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  30.46 
 
 
369 aa  157  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  34.78 
 
 
324 aa  157  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  36.08 
 
 
692 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4906  phosphate binding protein  34.42 
 
 
357 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.265302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0192  phosphate binding protein  34.23 
 
 
312 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  32.62 
 
 
333 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.33 
 
 
342 aa  146  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  31.8 
 
 
297 aa  146  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  30.58 
 
 
332 aa  145  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  34.39 
 
 
326 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  30.49 
 
 
338 aa  139  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  31.39 
 
 
349 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  32.2 
 
 
339 aa  138  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  32.01 
 
 
331 aa  137  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  32.54 
 
 
658 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  30.54 
 
 
612 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  29.48 
 
 
340 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  29.48 
 
 
340 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  34.98 
 
 
337 aa  133  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  28.34 
 
 
620 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  31.25 
 
 
333 aa  131  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  32.11 
 
 
334 aa  131  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  29.47 
 
 
352 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  29.18 
 
 
608 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  28.5 
 
 
610 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  31.84 
 
 
333 aa  129  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  30.83 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  29.87 
 
 
607 aa  128  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  30.19 
 
 
341 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  28.3 
 
 
607 aa  128  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  28.57 
 
 
347 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  28.57 
 
 
347 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0440  chaperone protein DnaK  28.64 
 
 
618 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00195865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  28.3 
 
 
596 aa  126  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1181  molecular chaperone, DnaK family  27.46 
 
 
636 aa  125  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0502129  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  28.86 
 
 
596 aa  125  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  29.73 
 
 
613 aa  125  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  32.71 
 
 
326 aa  125  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4233  chaperone protein DnaK  28.38 
 
 
623 aa  125  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0369  molecular chaperone DnaK  26.97 
 
 
591 aa  125  5e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.19 
 
 
340 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  28.11 
 
 
609 aa  124  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  29.75 
 
 
340 aa  124  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  28.67 
 
 
332 aa  124  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  30.32 
 
 
616 aa  123  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  33.24 
 
 
657 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  27.2 
 
 
600 aa  124  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36840  hypothetical protein  32.34 
 
 
446 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  28.85 
 
 
617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  29.62 
 
 
615 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  27.16 
 
 
637 aa  122  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  29.16 
 
 
619 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  28.68 
 
 
617 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0889  molecular chaperone DnaK  27.81 
 
 
617 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  26.91 
 
 
636 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  29.38 
 
 
605 aa  121  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  28.38 
 
 
621 aa  121  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  28.88 
 
 
619 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  28.38 
 
 
600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  29.06 
 
 
620 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  28.74 
 
 
640 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  28.27 
 
 
621 aa  119  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04420  chaperone protein DnaK  29.11 
 
 
619 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4127  molecular chaperone DnaK  28.61 
 
 
630 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  30.03 
 
 
615 aa  118  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  28.54 
 
 
612 aa  118  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  27.73 
 
 
618 aa  118  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1798  molecular chaperone DnaK  27.32 
 
 
616 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0096  chaperone protein DnaK  27.11 
 
 
636 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0207175 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  28.62 
 
 
302 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  28.79 
 
 
613 aa  117  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05490  chaperone protein DnaK  27.54 
 
 
631 aa  117  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1403  molecular chaperone DnaK  28.01 
 
 
625 aa  117  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000203004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  28.19 
 
 
610 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  27.75 
 
 
607 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  28.25 
 
 
621 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  26.91 
 
 
637 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0529  class I heat-shock protein (chaperonin)  28.96 
 
 
623 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  26.95 
 
 
617 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  27.59 
 
 
622 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.08 
 
 
305 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0145  heat shock protein 70  30.03 
 
 
577 aa  117  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2156  molecular chaperone DnaK  26.96 
 
 
640 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0201  chaperone protein DnaK  28.88 
 
 
621 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00131999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  28.7 
 
 
618 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  25.81 
 
 
649 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3460  chaperone protein DnaK  29.15 
 
 
612 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  29.52 
 
 
634 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  27.55 
 
 
644 aa  115  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>