More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_36840  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  889    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  35.5 
 
 
683 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  35.73 
 
 
880 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0558  molecular chaperone-like protein  35.29 
 
 
439 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  35.17 
 
 
632 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  33.62 
 
 
631 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  32.27 
 
 
957 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  30.05 
 
 
858 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3003  heat shock protein 70  31.93 
 
 
935 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376537  normal  0.234156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  26.05 
 
 
649 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  27.09 
 
 
640 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  31.48 
 
 
658 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3675  Heat shock protein 70  29.89 
 
 
698 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201192  normal  0.0422878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2974  Heat shock protein 70  29.46 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458744  normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  31.36 
 
 
657 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  27.75 
 
 
380 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  31.43 
 
 
665 aa  89.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  26.54 
 
 
609 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  28.83 
 
 
597 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0145  heat shock protein 70  26.46 
 
 
577 aa  88.2  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  31.17 
 
 
643 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0096  chaperone protein DnaK  23.78 
 
 
636 aa  84  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0207175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  24.38 
 
 
617 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6423  putative phosphate-binding protein of phosphate ABC transporter  29.24 
 
 
804 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81421  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  28.92 
 
 
632 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  26.78 
 
 
608 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  25.75 
 
 
612 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  26.3 
 
 
607 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0935  molecular chaperone DnaK  24.28 
 
 
622 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.550928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2824  2-alkenal reductase  27.3 
 
 
485 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  25.67 
 
 
607 aa  76.6  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  22.29 
 
 
596 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  24.93 
 
 
621 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  25.62 
 
 
615 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  23.35 
 
 
596 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1258  molecular chaperone DnaK  24.35 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.757771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  25.89 
 
 
616 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1873  Heat shock protein 70  26.76 
 
 
527 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0915077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0850  molecular chaperone DnaK  24.35 
 
 
623 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  27.17 
 
 
612 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0775  molecular chaperone DnaK  24.35 
 
 
623 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.175007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  25.15 
 
 
605 aa  74.3  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1348  chaperone protein DnaK  21.92 
 
 
614 aa  73.9  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  24.44 
 
 
600 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  24.78 
 
 
620 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  23.1 
 
 
596 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  23.1 
 
 
596 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  24.14 
 
 
605 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6998  2-alkenal reductase  24.54 
 
 
546 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0832  heat shock protein 70  26.04 
 
 
633 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.901264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  25.32 
 
 
633 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0148  molecular chaperone DnaK  24.09 
 
 
625 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0238648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  24.93 
 
 
607 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3821  chaperone protein DnaK  25.76 
 
 
638 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  23.77 
 
 
626 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2156  molecular chaperone DnaK  22.98 
 
 
640 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  23.96 
 
 
637 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  26.81 
 
 
614 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  23.9 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00560  molecular chaperone DnaK  24.68 
 
 
621 aa  70.5  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  23.56 
 
 
615 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06010  Heat shock 70 kDa protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0C0]  24.35 
 
 
666 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  24.31 
 
 
644 aa  70.5  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2046  molecular chaperone DnaK  24.74 
 
 
623 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000592664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0336  molecular chaperone DnaK  25.06 
 
 
631 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0107713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  25.27 
 
 
617 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0191  molecular chaperone DnaK  25.32 
 
 
631 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1707  molecular chaperone DnaK  24.38 
 
 
642 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108281  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  22.77 
 
 
637 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  25.32 
 
 
633 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0761  molecular chaperone DnaK  23.61 
 
 
639 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1358  chaperone protein DnaK  22.8 
 
 
626 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00416973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  23.58 
 
 
619 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  23.85 
 
 
640 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1119  molecular chaperone DnaK  24.58 
 
 
634 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17633  predicted protein  22.45 
 
 
673 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  24.1 
 
 
613 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  24.42 
 
 
645 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  25.29 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  26.53 
 
 
610 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  23.27 
 
 
600 aa  67.4  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02253  molecular chaperone DnaK  25 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.402968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  25.64 
 
 
632 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  23.31 
 
 
619 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  25 
 
 
861 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19141  molecular chaperone DnaK  24.68 
 
 
635 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18951  molecular chaperone DnaK  24.68 
 
 
635 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05490  chaperone protein DnaK  25 
 
 
631 aa  67  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1987  molecular chaperone DnaK  24.68 
 
 
639 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  25.22 
 
 
618 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0643  chaperone protein HscA  30.68 
 
 
355 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6427  molecular chaperone DnaK  24.86 
 
 
636 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.602415 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  25.64 
 
 
630 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4793  chaperone protein DnaK  23.96 
 
 
637 aa  66.6  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126797  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0755  molecular chaperone DnaK  22.77 
 
 
640 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.197988  normal  0.199452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3673  heat shock protein 70  27.55 
 
 
556 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192305  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  25.64 
 
 
632 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78689  mitochondrial heat shock protein of the HSP70 family upregulated 15 fold under aerobic conditions  23.96 
 
 
647 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  23.98 
 
 
633 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  24.42 
 
 
607 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>