More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  100 
 
 		 665 aa  1336    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  69.84 
 
 		 643 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  43.42 
 
 		 657 aa  337  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  43.95 
 
 		 658 aa  316  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2974  Heat shock protein 70  42.34 
 
 		 473 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458744  normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  42.86 
 
 		 858 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  41.85 
 
 		 380 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  42.7 
 
 		 597 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3675  Heat shock protein 70  41.99 
 
 		 698 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201192  normal  0.0422878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  42.42 
 
 		 632 aa  227  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  42.9 
 
 		 816 aa  220  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  35.04 
 
 		 861 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0643  chaperone protein HscA  37.58 
 
 		 355 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  32.71 
 
 		 880 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1150  heat shock protein 70  32.89 
 
 		 414 aa  138  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2371  molecular chaperone DnaK  28.35 
 
 		 641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0498506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  29.42 
 
 		 644 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  29.42 
 
 		 644 aa  132  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  27.08 
 
 		 640 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  34.17 
 
 		 683 aa  127  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0763  molecular chaperone DnaK  27.52 
 
 		 638 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.240702  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  27.63 
 
 		 635 aa  124  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3853  molecular chaperone DnaK  29.05 
 
 		 635 aa  124  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.458141  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  27.87 
 
 		 638 aa  123  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3659  molecular chaperone DnaK  29.05 
 
 		 635 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.221708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  29.44 
 
 		 621 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4505  dnaK protein  27.89 
 
 		 638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.493452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3624  molecular chaperone DnaK  28.64 
 
 		 637 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0972  molecular chaperone DnaK  31.06 
 
 		 641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  29.11 
 
 		 639 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42970  molecular chaperone DnaK  27.7 
 
 		 642 aa  121  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0015  molecular chaperone DnaK  28.09 
 
 		 638 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  28.04 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  28.04 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0017  molecular chaperone DnaK  28.04 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0014  molecular chaperone DnaK  28.04 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3642  molecular chaperone DnaK  28.04 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0012  molecular chaperone DnaK  28.04 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0014  molecular chaperone DnaK  28.04 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.720404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00014  hypothetical protein  28.04 
 
 		 638 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  28.38 
 
 		 634 aa  120  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4727  molecular chaperone DnaK  27.8 
 
 		 641 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4195  molecular chaperone DnaK  27.73 
 
 		 638 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.697831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3362  molecular chaperone DnaK  29.21 
 
 		 641 aa  120  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00483084  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4593  molecular chaperone DnaK  27.8 
 
 		 611 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0705  molecular chaperone DnaK  28.47 
 
 		 642 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.991542  hitchhiker  0.00373159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0013  molecular chaperone DnaK  29.93 
 
 		 638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0012  molecular chaperone DnaK  29.93 
 
 		 638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.276722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0013  molecular chaperone DnaK  29.93 
 
 		 638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0578  molecular chaperone DnaK  28.09 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0013  molecular chaperone DnaK  29.93 
 
 		 638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.767779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4728  molecular chaperone DnaK  27.52 
 
 		 641 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  28.28 
 
 		 613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0013  molecular chaperone DnaK  29.93 
 
 		 638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.693638  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3961  molecular chaperone DnaK  27.79 
 
 		 653 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727521  normal  0.0784984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  29.87 
 
 		 612 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0737  molecular chaperone DnaK  26.98 
 
 		 650 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  32.98 
 
 		 631 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0382  molecular chaperone DnaK  27.8 
 
 		 635 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  29.84 
 
 		 608 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  28.05 
 
 		 611 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0797  molecular chaperone DnaK  28.78 
 
 		 636 aa  117  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000118812  normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3594  molecular chaperone DnaK  28.78 
 
 		 636 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107379  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  27.9 
 
 		 610 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3466  molecular chaperone DnaK  28.78 
 
 		 636 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000062983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0919  molecular chaperone DnaK  29.5 
 
 		 688 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.628241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  27.9 
 
 		 610 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0692  molecular chaperone DnaK  28.61 
 
 		 637 aa  117  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00232011  hitchhiker  0.00343274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1250  molecular chaperone DnaK  28.86 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5231  molecular chaperone DnaK  27.11 
 
 		 648 aa  117  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3505  molecular chaperone DnaK  27.27 
 
 		 640 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00228392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  29.84 
 
 		 617 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  27.3 
 
 		 649 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  28.16 
 
 		 609 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2665  chaperone protein Dnak  26.8 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  27.25 
 
 		 637 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5481  molecular chaperone DnaK  28.6 
 
 		 637 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2456  molecular chaperone DnaK  27.89 
 
 		 647 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00641905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0581  molecular chaperone DnaK  27.22 
 
 		 639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3373  chaperone protein DnaK  27.25 
 
 		 633 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0334464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0542  molecular chaperone DnaK  26.72 
 
 		 636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2291  chaperone protein DnaK  26.8 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1600  molecular chaperone DnaK  27.61 
 
 		 641 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.56491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2922  molecular chaperone DnaK  26.39 
 
 		 648 aa  115  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3964  molecular chaperone DnaK  26.85 
 
 		 637 aa  115  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.734974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  28.6 
 
 		 637 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  26.92 
 
 		 600 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2132  molecular chaperone DnaK  27.89 
 
 		 647 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0108492  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3574  molecular chaperone DnaK  27.27 
 
 		 640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  26.8 
 
 		 637 aa  114  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1472  chaperone protein DnaK  28.97 
 
 		 634 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0182845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1969  molecular chaperone DnaK  27.11 
 
 		 651 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00608101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004291  chaperone protein DnaK  27.47 
 
 		 637 aa  114  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  26.69 
 
 		 609 aa  114  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1484  molecular chaperone DnaK  26.59 
 
 		 640 aa  114  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.840075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1769  molecular chaperone DnaK  26.59 
 
 		 644 aa  114  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00650  chaperone protein DnaK  26.41 
 
 		 642 aa  113  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0257003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1987  molecular chaperone DnaK  27.24 
 
 		 639 aa  113  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2811  heat shock protein Hsp70  26.85 
 
 		 640 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0535458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0211  molecular chaperone DnaK  27.27 
 
 		 635 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000228003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>