More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1148 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  55.82 
 
 
638 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  55.82 
 
 
638 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  62.03 
 
 
658 aa  719    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  59.38 
 
 
637 aa  715    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  61.64 
 
 
636 aa  748    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4727  molecular chaperone DnaK  57.37 
 
 
641 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  60.16 
 
 
640 aa  739    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  58.67 
 
 
646 aa  723    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
609 aa  1218    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  57.48 
 
 
641 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  56.07 
 
 
640 aa  686    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2635  molecular chaperone DnaK  55.85 
 
 
688 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0170334  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  75.08 
 
 
611 aa  938    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  75.74 
 
 
609 aa  856    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  61.57 
 
 
637 aa  754    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1126  molecular chaperone DnaK  56.28 
 
 
639 aa  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4505  dnaK protein  56.04 
 
 
638 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.493452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  74.1 
 
 
611 aa  931    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  74.1 
 
 
611 aa  931    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl415  molecular chaperone DnaK  61.19 
 
 
592 aa  707    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.847356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  74.1 
 
 
611 aa  931    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  56.7 
 
 
644 aa  699    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  56.7 
 
 
644 aa  699    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4195  molecular chaperone DnaK  55.73 
 
 
638 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.697831  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2132  molecular chaperone DnaK  53.87 
 
 
647 aa  671    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0108492  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  60.52 
 
 
613 aa  734    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  58.93 
 
 
630 aa  726    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2785  molecular chaperone DnaK  55.81 
 
 
647 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134796  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0554  molecular chaperone DnaK  54.95 
 
 
634 aa  669    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  62.32 
 
 
620 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  56.65 
 
 
639 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  59.65 
 
 
630 aa  726    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  55.63 
 
 
629 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  58.7 
 
 
633 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0378  molecular chaperone DnaK  56.88 
 
 
653 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2811  heat shock protein Hsp70  57.28 
 
 
640 aa  704    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0535458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0763  molecular chaperone DnaK  57.55 
 
 
638 aa  689    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.240702  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  58.87 
 
 
636 aa  716    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  61.48 
 
 
634 aa  765    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  58.71 
 
 
637 aa  725    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  60.5 
 
 
639 aa  724    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  59.77 
 
 
637 aa  724    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  60.67 
 
 
637 aa  724    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  61.91 
 
 
638 aa  755    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  59.72 
 
 
637 aa  758    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  57.9 
 
 
638 aa  691    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  74.1 
 
 
611 aa  931    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  58.08 
 
 
645 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  60.16 
 
 
634 aa  739    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  56.7 
 
 
644 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0369  molecular chaperone DnaK  59.1 
 
 
591 aa  682    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  60.41 
 
 
639 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  66.78 
 
 
612 aa  805    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4328  molecular chaperone DnaK  56.38 
 
 
609 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.977158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  62.72 
 
 
616 aa  690    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  59.69 
 
 
633 aa  732    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  57.52 
 
 
635 aa  683    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  62.27 
 
 
610 aa  733    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0471  molecular chaperone DnaK  54.65 
 
 
635 aa  672    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0555822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0212  molecular chaperone DnaK  61.1 
 
 
639 aa  704    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2733  molecular chaperone DnaK  55.68 
 
 
643 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000184427  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  59.21 
 
 
632 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0751  chaperone DnaK  56.49 
 
 
640 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.805739  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  64.69 
 
 
620 aa  764    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  59.37 
 
 
633 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  55.28 
 
 
644 aa  683    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  60 
 
 
632 aa  730    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  58.83 
 
 
644 aa  697    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  59.32 
 
 
642 aa  714    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  58.88 
 
 
643 aa  718    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  58.83 
 
 
634 aa  713    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  60 
 
 
622 aa  695    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  60.9 
 
 
636 aa  729    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1987  molecular chaperone DnaK  55.76 
 
 
639 aa  668    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  62.89 
 
 
636 aa  768    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  60.79 
 
 
632 aa  739    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  66.43 
 
 
619 aa  776    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  64.03 
 
 
619 aa  788    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  57.89 
 
 
635 aa  697    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  56.81 
 
 
638 aa  693    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0957  molecular chaperone DnaK  56.12 
 
 
639 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0995  molecular chaperone DnaK  56.12 
 
 
639 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0204392  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  58.18 
 
 
671 aa  720    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  67.43 
 
 
610 aa  818    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  58.58 
 
 
636 aa  694    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  56.36 
 
 
637 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  74.96 
 
 
607 aa  900    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  65.54 
 
 
617 aa  790    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0822  molecular chaperone DnaK  73 
 
 
623 aa  844    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.762106 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1347  molecular chaperone DnaK  69.42 
 
 
615 aa  839    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.730753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  75.57 
 
 
607 aa  852    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  59.08 
 
 
622 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  57.14 
 
 
615 aa  698    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  59.28 
 
 
641 aa  740    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  60.33 
 
 
653 aa  713    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0959  molecular chaperone DnaK  56.12 
 
 
639 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0334727  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  61.3 
 
 
618 aa  699    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  60.22 
 
 
636 aa  743    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  57.91 
 
 
640 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  58.69 
 
 
638 aa  713    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>