More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0643 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0643  chaperone protein HscA  100 
 
 
355 aa  684    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2974  Heat shock protein 70  44.73 
 
 
473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458744  normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  49.36 
 
 
597 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  46.06 
 
 
858 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  45.43 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  47.6 
 
 
632 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  46.82 
 
 
816 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3675  Heat shock protein 70  45.83 
 
 
698 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201192  normal  0.0422878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  43.67 
 
 
658 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  42.68 
 
 
657 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  36.97 
 
 
665 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  39.68 
 
 
643 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1150  heat shock protein 70  36.7 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  34.39 
 
 
880 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3673  heat shock protein 70  32.51 
 
 
556 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192305  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  34.16 
 
 
861 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  33.75 
 
 
631 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  29 
 
 
649 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  33.44 
 
 
632 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1059  2-alkenal reductase  32.58 
 
 
580 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00230509  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  27.02 
 
 
640 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  32.52 
 
 
872 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  27.66 
 
 
617 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  27.38 
 
 
578 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1108  chaperone protein HscA  30.21 
 
 
616 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  27.02 
 
 
607 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2846  molecular chaperone DnaK  28.53 
 
 
636 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.769317  normal  0.885007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0571  chaperone protein DnaK  26.99 
 
 
651 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2013  chaperone protein DnaK  26.5 
 
 
636 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  28.92 
 
 
644 aa  99.8  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  27.08 
 
 
608 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0310  molecular chaperone DnaK  27.52 
 
 
644 aa  99.8  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119566  Luminal binding protein precursor, probable  26.24 
 
 
662 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0293386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  28.21 
 
 
596 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  28.21 
 
 
596 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  28.44 
 
 
621 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0179  heat shock protein 70  25 
 
 
571 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.633289  normal  0.123381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3585  Heat shock protein 70  30 
 
 
525 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  27.67 
 
 
610 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  27.67 
 
 
610 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  26.99 
 
 
621 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1395  Heat shock protein 70  30.16 
 
 
538 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.176666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0804  Fe-S protein assembly chaperone HscA  28.1 
 
 
622 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.428496  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1348  chaperone protein DnaK  24.39 
 
 
614 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  27.27 
 
 
596 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1452  molecular chaperone DnaK  23.81 
 
 
498 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  27.5 
 
 
615 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  26.93 
 
 
609 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl415  molecular chaperone DnaK  25.79 
 
 
592 aa  93.2  6e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.847356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  29.82 
 
 
568 aa  92.8  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1873  Heat shock protein 70  28.16 
 
 
527 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0915077  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0935  molecular chaperone DnaK  26.67 
 
 
622 aa  92.4  9e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.550928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  26.5 
 
 
607 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  31.87 
 
 
683 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  30.51 
 
 
621 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  26.88 
 
 
620 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  26.09 
 
 
605 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  26.9 
 
 
611 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  26.9 
 
 
611 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  28.09 
 
 
600 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2258  chaperone protein HscA  30.59 
 
 
618 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0145  heat shock protein 70  29.25 
 
 
577 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2286  chaperone protein HscA  29.52 
 
 
620 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588837  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004356  chaperone protein HscA  30.54 
 
 
617 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  26.58 
 
 
611 aa  89.7  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  26.93 
 
 
619 aa  89.7  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1043  chaperone protein HscA  31.56 
 
 
621 aa  89.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  26.63 
 
 
613 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2055  2-alkenal reductase  28.49 
 
 
623 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.223423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  27.05 
 
 
612 aa  89.4  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0822  molecular chaperone DnaK  27.36 
 
 
623 aa  89.4  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.762106 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  26.72 
 
 
637 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3507  chaperone protein HscA  29.13 
 
 
621 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  27.53 
 
 
617 aa  88.6  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  28.26 
 
 
622 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1798  molecular chaperone DnaK  25.39 
 
 
616 aa  88.6  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  26.58 
 
 
611 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1142  dnak protein, truncation  26.35 
 
 
505 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  26.58 
 
 
611 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  26.58 
 
 
611 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  26.58 
 
 
611 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18810  chaperone protein DnaK  28.44 
 
 
619 aa  88.6  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000228841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  26.58 
 
 
611 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  26.58 
 
 
611 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  26.99 
 
 
612 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  26.58 
 
 
611 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  26.96 
 
 
607 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  28.34 
 
 
572 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_002978  WD0892  chaperone protein HscA  27.43 
 
 
582 aa  87.4  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  28.48 
 
 
609 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01059  chaperone protein HscA  29.94 
 
 
617 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2747  chaperone protein HscA  29.04 
 
 
616 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4233  chaperone protein DnaK  29.45 
 
 
623 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  24.86 
 
 
596 aa  87  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1462  chaperone protein HscA  27.81 
 
 
619 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0476336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  26.63 
 
 
619 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  24.77 
 
 
610 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  31.38 
 
 
780 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0346  molecular chaperone DnaK  24.31 
 
 
600 aa  86.7  5e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.000727385  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0876  chaperone protein HscA  30.24 
 
 
620 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70427  normal  0.314154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>