More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3774 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  57.75 
 
 
569 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  77.37 
 
 
572 aa  910    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  100 
 
 
572 aa  1159    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  56.41 
 
 
593 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  56.86 
 
 
569 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  54.45 
 
 
564 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  49.56 
 
 
566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  54.43 
 
 
565 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  49.2 
 
 
566 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  49.2 
 
 
566 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  54.08 
 
 
564 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  51.78 
 
 
565 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  50.71 
 
 
563 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  52.21 
 
 
572 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  48.15 
 
 
556 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  48.15 
 
 
556 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  48.15 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  48.15 
 
 
556 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  48.34 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  48.15 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  48.15 
 
 
566 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  48.15 
 
 
556 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  47.97 
 
 
556 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  47.55 
 
 
559 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  47.37 
 
 
559 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  47.83 
 
 
568 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  47.55 
 
 
559 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  45.66 
 
 
563 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  47.37 
 
 
559 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  44.84 
 
 
563 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  44.18 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  40.55 
 
 
552 aa  435  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  39.51 
 
 
578 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  44.62 
 
 
607 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  43.69 
 
 
616 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  39.23 
 
 
617 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  44.06 
 
 
607 aa  392  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  44.65 
 
 
607 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  42.22 
 
 
621 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  42.88 
 
 
605 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  43.81 
 
 
609 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  40.04 
 
 
605 aa  385  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  40.96 
 
 
612 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  43.38 
 
 
626 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  42.22 
 
 
615 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  39.03 
 
 
607 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  43.06 
 
 
611 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  41.38 
 
 
610 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  42.66 
 
 
607 aa  378  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  42.23 
 
 
624 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  42.16 
 
 
609 aa  375  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  42.42 
 
 
622 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  41.62 
 
 
636 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  41.45 
 
 
596 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  42.8 
 
 
607 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  38.38 
 
 
608 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  42.24 
 
 
596 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  39.82 
 
 
636 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  40.14 
 
 
620 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  42.42 
 
 
613 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0094  chaperone protein DnaK  41.23 
 
 
634 aa  369  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.512015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  41.82 
 
 
614 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  42.02 
 
 
611 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  39.93 
 
 
613 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  42.36 
 
 
611 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4165  molecular chaperone DnaK  42.77 
 
 
611 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0072304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  42.08 
 
 
613 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18810  chaperone protein DnaK  42.69 
 
 
619 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000228841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4187  molecular chaperone DnaK  40.98 
 
 
691 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.793765  normal  0.583998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  38.17 
 
 
636 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  41.78 
 
 
613 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  42.8 
 
 
618 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2311  chaperone protein DnaK  37.94 
 
 
620 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000072076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  42.69 
 
 
613 aa  368  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  42.45 
 
 
611 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  42.45 
 
 
611 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  42.45 
 
 
611 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  42.45 
 
 
611 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  42.77 
 
 
617 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  42.45 
 
 
611 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  42.45 
 
 
611 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  42.45 
 
 
611 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  40.88 
 
 
629 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  42.39 
 
 
622 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  40.33 
 
 
607 aa  364  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2048  chaperone protein DnaK  42.41 
 
 
622 aa  363  5.0000000000000005e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00388714  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5471  chaperone protein DnaK  42.19 
 
 
616 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  40.57 
 
 
610 aa  363  6e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  39.64 
 
 
602 aa  362  8e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  41.57 
 
 
615 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  41.01 
 
 
612 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  40.97 
 
 
609 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  41.72 
 
 
621 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  42.28 
 
 
596 aa  361  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  37.83 
 
 
617 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  42.8 
 
 
627 aa  361  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00650  chaperone protein DnaK  40.08 
 
 
642 aa  361  2e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0257003  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  42.28 
 
 
596 aa  361  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  41.18 
 
 
610 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  41.18 
 
 
610 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>