More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7074 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  57.67 
 
 
593 aa  646    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  58.23 
 
 
572 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  91.92 
 
 
569 aa  1066    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  100 
 
 
569 aa  1148    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  57.75 
 
 
572 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  55.48 
 
 
564 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  55.6 
 
 
565 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  50.55 
 
 
566 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  50.36 
 
 
566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  55.24 
 
 
564 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  50.36 
 
 
566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  50.45 
 
 
565 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  50.62 
 
 
563 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  50.18 
 
 
572 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  49.82 
 
 
566 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  47.91 
 
 
568 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  46.44 
 
 
563 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  45.89 
 
 
563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  45.24 
 
 
556 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  45.55 
 
 
556 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  45.55 
 
 
556 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  45.57 
 
 
556 aa  465  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  45.06 
 
 
556 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  45.55 
 
 
556 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  45.37 
 
 
556 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  45.55 
 
 
556 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  44 
 
 
584 aa  456  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  44.9 
 
 
559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  44.9 
 
 
559 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  44.9 
 
 
559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  45.05 
 
 
559 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  41.06 
 
 
552 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  38.47 
 
 
578 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  44.92 
 
 
607 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  40.5 
 
 
608 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  38.82 
 
 
617 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  40.9 
 
 
622 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  38.13 
 
 
621 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  40.34 
 
 
622 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  39.17 
 
 
607 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  40.49 
 
 
616 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  36.87 
 
 
602 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  38.51 
 
 
612 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  38.61 
 
 
605 aa  365  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  39.28 
 
 
607 aa  364  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  38.74 
 
 
607 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0449  molecular chaperone DnaK  40.15 
 
 
622 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  40.15 
 
 
622 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  40.15 
 
 
622 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  38.53 
 
 
605 aa  362  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  43.76 
 
 
600 aa  362  8e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02520  chaperone, putative  40.82 
 
 
644 aa  361  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  37.89 
 
 
610 aa  360  5e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  39.33 
 
 
615 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  38.34 
 
 
630 aa  359  6e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6949  molecular chaperone DnaK  42.42 
 
 
619 aa  359  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  38.28 
 
 
613 aa  359  7e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  41.24 
 
 
596 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  38.92 
 
 
620 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10355  molecular chaperone DnaK  39.59 
 
 
625 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  41.44 
 
 
617 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02320  heat shock protein 70, putative  40.64 
 
 
640 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  42.01 
 
 
619 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  35.49 
 
 
638 aa  356  7.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  42.06 
 
 
611 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0070  chaperone protein DnaK  38.04 
 
 
642 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  42.15 
 
 
607 aa  355  1e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  41.77 
 
 
618 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  40.64 
 
 
613 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  37.26 
 
 
612 aa  355  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4693  molecular chaperone DnaK  38.23 
 
 
643 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3505  molecular chaperone DnaK  36.98 
 
 
640 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00228392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  37.24 
 
 
610 aa  354  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3574  molecular chaperone DnaK  36.98 
 
 
640 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  40.24 
 
 
636 aa  353  4e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  40.24 
 
 
636 aa  353  5.9999999999999994e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0346  molecular chaperone DnaK  38.19 
 
 
600 aa  353  7e-96  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.000727385  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  41.65 
 
 
644 aa  352  7e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2631  molecular chaperone DnaK  39.73 
 
 
627 aa  352  8.999999999999999e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0494047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  41.86 
 
 
613 aa  352  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  41.36 
 
 
616 aa  352  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0211  molecular chaperone DnaK  37.81 
 
 
635 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000228003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0486  chaperone protein DnaK  41.48 
 
 
613 aa  351  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  41.92 
 
 
609 aa  351  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  42.39 
 
 
613 aa  351  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  37.74 
 
 
620 aa  351  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  38.5 
 
 
611 aa  352  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0233  molecular chaperone DnaK  41.36 
 
 
612 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  40.81 
 
 
619 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  37.48 
 
 
609 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0094  chaperone protein DnaK  41.9 
 
 
634 aa  351  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.512015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  42.3 
 
 
627 aa  351  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  41.24 
 
 
613 aa  350  3e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  39.4 
 
 
626 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2311  chaperone protein DnaK  41.03 
 
 
620 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000072076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  37.35 
 
 
620 aa  350  4e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  40.61 
 
 
619 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  40.34 
 
 
613 aa  350  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  41.12 
 
 
607 aa  350  5e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1750  molecular chaperone DnaK  36.24 
 
 
690 aa  349  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>