More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0776 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  82.91 
 
 
556 aa  964    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  83.09 
 
 
556 aa  966    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  99.64 
 
 
559 aa  1148    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  82.91 
 
 
556 aa  963    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  82.91 
 
 
556 aa  961    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  99.64 
 
 
559 aa  1148    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  57.87 
 
 
563 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  82.55 
 
 
556 aa  959    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  82.91 
 
 
556 aa  964    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  82.85 
 
 
556 aa  962    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  82.73 
 
 
556 aa  962    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  99.46 
 
 
559 aa  1145    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  100 
 
 
559 aa  1152    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  58.15 
 
 
563 aa  659    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  57.88 
 
 
563 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  46.63 
 
 
566 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  45.79 
 
 
566 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  45.79 
 
 
566 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  47.55 
 
 
572 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  44.68 
 
 
593 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  44.57 
 
 
564 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  45.42 
 
 
565 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  45.28 
 
 
572 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  46.18 
 
 
565 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  44.2 
 
 
564 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  45.49 
 
 
569 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  45.05 
 
 
569 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  44.63 
 
 
566 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  40.4 
 
 
552 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  41.77 
 
 
572 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  42.78 
 
 
568 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  40.14 
 
 
584 aa  375  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  38.59 
 
 
607 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  37.45 
 
 
630 aa  330  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  36.21 
 
 
610 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  34.87 
 
 
605 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  35.51 
 
 
596 aa  327  5e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  34.27 
 
 
607 aa  327  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  37.76 
 
 
608 aa  326  8.000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  36.79 
 
 
636 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  37.7 
 
 
616 aa  324  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  37.45 
 
 
607 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  36.01 
 
 
627 aa  321  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  35.29 
 
 
611 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10355  molecular chaperone DnaK  37.47 
 
 
625 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  36.82 
 
 
617 aa  319  7.999999999999999e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  34.94 
 
 
613 aa  319  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  35.22 
 
 
609 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  38.01 
 
 
621 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  36.94 
 
 
614 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  36.32 
 
 
596 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  34.7 
 
 
626 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  34.94 
 
 
613 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  36.32 
 
 
596 aa  317  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  35.23 
 
 
596 aa  317  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  35.22 
 
 
617 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  34.93 
 
 
607 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5471  chaperone protein DnaK  36.89 
 
 
616 aa  316  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  36.46 
 
 
622 aa  316  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0313  chaperone protein DnaK  37.06 
 
 
626 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000265757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  36.59 
 
 
624 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  37.04 
 
 
607 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0070  chaperone protein DnaK  36.52 
 
 
642 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113032  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  36.36 
 
 
622 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  36.36 
 
 
622 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0449  molecular chaperone DnaK  36.36 
 
 
622 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  35.86 
 
 
621 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  33.73 
 
 
636 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  34.68 
 
 
602 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  36.05 
 
 
622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  35.16 
 
 
615 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  36.2 
 
 
622 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0486  chaperone protein DnaK  34.1 
 
 
613 aa  313  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403398  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  37.01 
 
 
621 aa  312  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  34.58 
 
 
636 aa  312  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  33.1 
 
 
605 aa  311  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  37.32 
 
 
617 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  34.62 
 
 
578 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  37.87 
 
 
619 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  39.1 
 
 
600 aa  311  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  34.82 
 
 
613 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  36.55 
 
 
612 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  37.32 
 
 
613 aa  310  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  34.13 
 
 
629 aa  309  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  36.21 
 
 
612 aa  309  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  34.19 
 
 
634 aa  309  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0529  class I heat-shock protein (chaperonin)  37.76 
 
 
623 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  33.56 
 
 
633 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0211  molecular chaperone DnaK  35.23 
 
 
635 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000228003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  33.62 
 
 
643 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  35.35 
 
 
636 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30041  molecular chaperone DnaK  36.08 
 
 
637 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.417292 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18401  molecular chaperone DnaK  36.27 
 
 
634 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.188042  normal  0.971493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  32.93 
 
 
638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  35.7 
 
 
644 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0336  molecular chaperone DnaK  33.56 
 
 
631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0107713  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  36.73 
 
 
618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3505  molecular chaperone DnaK  33.5 
 
 
640 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00228392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0191  molecular chaperone DnaK  33.22 
 
 
631 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5218  chaperone protein DnaK  37.68 
 
 
616 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>