More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4294 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  58.6 
 
 		 593 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  100 
 
 		 564 aa  1144    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  85.41 
 
 		 564 aa  951    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  73.58 
 
 		 565 aa  834    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  55.95 
 
 		 569 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  54.8 
 
 		 572 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  54.45 
 
 		 572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  55.48 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  50.8 
 
 		 566 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  52.67 
 
 		 565 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  50.44 
 
 		 566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  50.44 
 
 		 566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  49.03 
 
 		 566 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  50.73 
 
 		 568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  47.86 
 
 		 563 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  49.91 
 
 		 572 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  49.47 
 
 		 563 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  46.96 
 
 		 563 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  46.01 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  46.01 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  46.01 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  46.01 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  45.83 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  46.01 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  46.03 
 
 		 556 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  45.83 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  44.57 
 
 		 559 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  44.57 
 
 		 559 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  44.38 
 
 		 559 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  44.38 
 
 		 559 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  43.37 
 
 		 552 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  43.95 
 
 		 584 aa  440  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  42.18 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  39.84 
 
 		 621 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  37.08 
 
 		 617 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  40.39 
 
 		 607 aa  359  6e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  40.74 
 
 		 616 aa  359  9e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0094  chaperone protein DnaK  39.84 
 
 		 634 aa  358  1.9999999999999998e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.512015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  38.43 
 
 		 636 aa  358  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  38.14 
 
 		 607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  39.3 
 
 		 610 aa  356  5.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  40.16 
 
 		 617 aa  356  7.999999999999999e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1250  molecular chaperone DnaK  39.8 
 
 		 630 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  39.17 
 
 		 636 aa  355  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0004  molecular chaperone DnaK  39.14 
 
 		 631 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0827361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00650  chaperone protein DnaK  39.04 
 
 		 642 aa  353  4e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0257003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  39.55 
 
 		 615 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  40.24 
 
 		 607 aa  353  5e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  36.47 
 
 		 612 aa  352  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  42.24 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  36.52 
 
 		 611 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1328  molecular chaperone DnaK  37.18 
 
 		 631 aa  350  3e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  39.52 
 
 		 614 aa  350  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3574  chaperone protein DnaK  38.86 
 
 		 639 aa  349  7e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.662017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  37.59 
 
 		 605 aa  348  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  36.36 
 
 		 602 aa  348  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  39.11 
 
 		 613 aa  348  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  36.49 
 
 		 638 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  38.78 
 
 		 622 aa  348  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  40 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3389  molecular chaperone DnaK  38.29 
 
 		 641 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0790  molecular chaperone DnaK  38.29 
 
 		 636 aa  347  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0357423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  40.28 
 
 		 626 aa  347  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2960  chaperone protein DnaK  37.52 
 
 		 639 aa  346  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3186  chaperone protein DnaK  37.52 
 
 		 639 aa  346  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0935  molecular chaperone DnaK  38.46 
 
 		 622 aa  346  6e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.550928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2893  molecular chaperone DnaK  38.2 
 
 		 635 aa  346  8e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000189329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3142  chaperone protein DnaK  37.52 
 
 		 639 aa  346  8e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  39.34 
 
 		 600 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02320  heat shock protein 70, putative  38.42 
 
 		 640 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  39.79 
 
 		 608 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3919  chaperone protein DnaK  37.52 
 
 		 638 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6270  chaperone protein DnaK  37.9 
 
 		 639 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2183  chaperone protein DnaK  39.77 
 
 		 640 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  39.8 
 
 		 609 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  37.26 
 
 		 605 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02520  chaperone, putative  38.23 
 
 		 644 aa  345  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6931  chaperone protein DnaK  37.9 
 
 		 637 aa  345  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  40.5 
 
 		 596 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  38.22 
 
 		 622 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  39.03 
 
 		 609 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  37.52 
 
 		 637 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  40.08 
 
 		 613 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31330  Heat Shock Protein 70  37.65 
 
 		 674 aa  343  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0297166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  40.59 
 
 		 615 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6427  molecular chaperone DnaK  41.72 
 
 		 636 aa  343  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.602415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  39.54 
 
 		 613 aa  343  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  37.72 
 
 		 607 aa  343  5e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0148  molecular chaperone DnaK  38.27 
 
 		 625 aa  343  5e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0238648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  39.52 
 
 		 611 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2041  molecular chaperone DnaK  37.33 
 
 		 637 aa  343  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  36.25 
 
 		 617 aa  342  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  35.65 
 
 		 619 aa  342  9e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  39.71 
 
 		 621 aa  342  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  37.94 
 
 		 635 aa  342  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  38.33 
 
 		 643 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  38.67 
 
 		 634 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0191  molecular chaperone DnaK  38.29 
 
 		 631 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  39.58 
 
 		 636 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  39 
 
 		 627 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>