More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2958 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  100 
 
 
566 aa  1121    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  48.13 
 
 
566 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  48.13 
 
 
566 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  47.78 
 
 
566 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  50.8 
 
 
593 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  49.03 
 
 
564 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  47.52 
 
 
565 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  50.36 
 
 
564 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  49.38 
 
 
565 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  49.82 
 
 
569 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  49.02 
 
 
569 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  48.15 
 
 
572 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  49.11 
 
 
572 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  47.77 
 
 
563 aa  465  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  49.81 
 
 
568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  43.14 
 
 
556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  43.72 
 
 
556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  43.72 
 
 
556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  43.53 
 
 
556 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  43.33 
 
 
556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  43.72 
 
 
556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  43.72 
 
 
556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  43.14 
 
 
556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  44.66 
 
 
563 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  44.64 
 
 
563 aa  445  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  44.63 
 
 
559 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  44.44 
 
 
559 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  44.63 
 
 
559 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  44.44 
 
 
559 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  42.29 
 
 
552 aa  432  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  44.55 
 
 
584 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  47.1 
 
 
572 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  45.33 
 
 
607 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  41.9 
 
 
617 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  42.6 
 
 
610 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  43.72 
 
 
608 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  41.2 
 
 
607 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  41.58 
 
 
607 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  40.08 
 
 
636 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  40.45 
 
 
602 aa  368  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  42.89 
 
 
616 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6427  molecular chaperone DnaK  39.66 
 
 
636 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.602415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  41.28 
 
 
605 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  40.69 
 
 
612 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  42.45 
 
 
596 aa  361  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  38.6 
 
 
638 aa  360  3e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  39.48 
 
 
613 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  41.12 
 
 
605 aa  360  4e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  40 
 
 
636 aa  359  6e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  42.11 
 
 
644 aa  359  7e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  40.67 
 
 
622 aa  359  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  41.67 
 
 
609 aa  359  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  40.94 
 
 
612 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  40.67 
 
 
622 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  40.55 
 
 
630 aa  358  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  42.29 
 
 
615 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0128  chaperone protein DnaK  39.53 
 
 
632 aa  357  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860677  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  41.17 
 
 
636 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  41.59 
 
 
613 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3460  chaperone protein DnaK  41.79 
 
 
612 aa  356  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  39.08 
 
 
578 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  42.77 
 
 
607 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  40.12 
 
 
626 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00650  chaperone protein DnaK  39.11 
 
 
642 aa  356  5.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0257003  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0571  chaperone protein DnaK  39.55 
 
 
651 aa  356  6.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  41.87 
 
 
600 aa  355  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  40.37 
 
 
614 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2955  chaperone protein DnaK  39.34 
 
 
634 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10355  molecular chaperone DnaK  41.19 
 
 
625 aa  355  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  39.92 
 
 
622 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  40.94 
 
 
610 aa  354  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  39.92 
 
 
624 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  39.44 
 
 
615 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  41.75 
 
 
607 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0440  chaperone protein DnaK  40.78 
 
 
618 aa  353  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00195865  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  39.53 
 
 
632 aa  353  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  41.87 
 
 
613 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  43.75 
 
 
596 aa  353  7e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  43.75 
 
 
596 aa  353  7e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  40.77 
 
 
621 aa  352  8e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18810  chaperone protein DnaK  41.65 
 
 
619 aa  352  8e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000228841  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  40.04 
 
 
634 aa  352  8e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0649  chaperone protein DnaK  42.64 
 
 
628 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  39.53 
 
 
630 aa  352  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4433  chaperone protein DnaK  41.43 
 
 
627 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  39.04 
 
 
643 aa  352  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0191  molecular chaperone DnaK  39.53 
 
 
631 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6931  chaperone protein DnaK  40.08 
 
 
637 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524879  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  39.93 
 
 
622 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0449  molecular chaperone DnaK  39.93 
 
 
622 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  39.93 
 
 
622 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2003  chaperone protein DnaK  38.98 
 
 
630 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000105798  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  41.26 
 
 
617 aa  351  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  39.88 
 
 
637 aa  350  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  41.99 
 
 
611 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  39.16 
 
 
635 aa  351  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  41.02 
 
 
617 aa  350  3e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  42.14 
 
 
618 aa  350  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1798  molecular chaperone DnaK  39.17 
 
 
616 aa  350  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0094  chaperone protein DnaK  39.49 
 
 
634 aa  350  5e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.512015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>