More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3997 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  58.67 
 
 
593 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  85.41 
 
 
564 aa  993    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  100 
 
 
564 aa  1146    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  74.87 
 
 
565 aa  842    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  54.88 
 
 
569 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  54.08 
 
 
572 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  55.24 
 
 
569 aa  611  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  54.45 
 
 
572 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  50.27 
 
 
566 aa  589  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  49.91 
 
 
566 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  49.91 
 
 
566 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  52.56 
 
 
565 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  50.36 
 
 
566 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  50.43 
 
 
572 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  50.99 
 
 
563 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  48.21 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  52.01 
 
 
568 aa  518  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  47.05 
 
 
563 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  46.74 
 
 
556 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  46.38 
 
 
556 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  46.38 
 
 
556 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  46.38 
 
 
556 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  46.38 
 
 
556 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  46.2 
 
 
556 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  46.2 
 
 
556 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  46.56 
 
 
556 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  44.2 
 
 
559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  44.2 
 
 
559 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  44.2 
 
 
559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  44.2 
 
 
559 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  44.23 
 
 
584 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  42.5 
 
 
552 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  39.8 
 
 
621 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  38.14 
 
 
578 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  36.77 
 
 
617 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  39.96 
 
 
636 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  40.64 
 
 
616 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  36.96 
 
 
612 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  39.71 
 
 
610 aa  364  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  37.41 
 
 
607 aa  363  6e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  40.16 
 
 
617 aa  360  5e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0094  chaperone protein DnaK  39.64 
 
 
634 aa  359  8e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.512015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  42.07 
 
 
607 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  40.99 
 
 
600 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  38.93 
 
 
636 aa  358  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0004  molecular chaperone DnaK  36.68 
 
 
631 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0827361  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  38.25 
 
 
607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  39.84 
 
 
607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  36.54 
 
 
608 aa  356  6.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1250  molecular chaperone DnaK  39.11 
 
 
630 aa  356  7.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  39.55 
 
 
615 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00650  chaperone protein DnaK  38.33 
 
 
642 aa  356  7.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0257003  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  34.87 
 
 
638 aa  355  7.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  35.54 
 
 
605 aa  353  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  40.2 
 
 
607 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  38.91 
 
 
611 aa  353  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  37.43 
 
 
605 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1328  molecular chaperone DnaK  35.48 
 
 
631 aa  352  7e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  38.91 
 
 
613 aa  352  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  36.46 
 
 
612 aa  351  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  37.44 
 
 
613 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  35.9 
 
 
602 aa  351  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  38.46 
 
 
614 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  38.97 
 
 
622 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31330  Heat Shock Protein 70  38.13 
 
 
674 aa  350  4e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0297166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  37.92 
 
 
636 aa  350  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  36.29 
 
 
626 aa  349  6e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1406  chaperone protein DnaK  38.3 
 
 
642 aa  350  6e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.343406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  39.8 
 
 
609 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  35.63 
 
 
634 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  37.68 
 
 
607 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3389  molecular chaperone DnaK  38.1 
 
 
641 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  37.64 
 
 
643 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2183  chaperone protein DnaK  38.21 
 
 
640 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137108  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  40.41 
 
 
596 aa  347  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0790  molecular chaperone DnaK  37.94 
 
 
636 aa  347  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0357423  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  37.07 
 
 
635 aa  347  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1750  molecular chaperone DnaK  38.08 
 
 
690 aa  347  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190119  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  38.45 
 
 
613 aa  346  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3460  chaperone protein DnaK  40.81 
 
 
612 aa  346  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf781  molecular chaperone DnaK  38.3 
 
 
598 aa  346  6e-94  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  39.03 
 
 
613 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  38.4 
 
 
622 aa  346  7e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4096  molecular chaperone DnaK  38.72 
 
 
639 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3574  chaperone protein DnaK  37.71 
 
 
639 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.662017  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  39.72 
 
 
611 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  39.4 
 
 
613 aa  345  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4392  chaperone protein DnaK  40.23 
 
 
615 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253837  normal  0.258584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  38.52 
 
 
637 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0303  molecular chaperone DnaK  38.15 
 
 
637 aa  345  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0486  chaperone protein DnaK  39.42 
 
 
613 aa  344  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  39.88 
 
 
618 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3919  chaperone protein DnaK  37.94 
 
 
638 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4416  molecular chaperone DnaK  38.52 
 
 
638 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  37.33 
 
 
637 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  40.44 
 
 
627 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  37.04 
 
 
619 aa  343  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  38.43 
 
 
609 aa  343  5e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2041  molecular chaperone DnaK  37.55 
 
 
637 aa  343  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2960  chaperone protein DnaK  35.18 
 
 
639 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>