More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2505 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  100 
 
 
565 aa  1159    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  52.19 
 
 
566 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  52.19 
 
 
566 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  52.19 
 
 
566 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  51.5 
 
 
593 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  52.67 
 
 
564 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  50.99 
 
 
569 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  51.78 
 
 
572 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  50.44 
 
 
572 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  52.56 
 
 
564 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  51.15 
 
 
565 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  50.45 
 
 
569 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  47.52 
 
 
566 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  48.31 
 
 
563 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  45.47 
 
 
563 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  45.83 
 
 
563 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  46.18 
 
 
559 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  46 
 
 
559 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  44.26 
 
 
568 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  46.18 
 
 
559 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  46 
 
 
559 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  44.42 
 
 
556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  44.42 
 
 
556 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  44.42 
 
 
556 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  43.96 
 
 
572 aa  452  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  44.42 
 
 
556 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  44.42 
 
 
556 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  45.71 
 
 
556 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  45.71 
 
 
556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  44.24 
 
 
556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  43.01 
 
 
552 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  42.32 
 
 
584 aa  434  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  45.11 
 
 
607 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  43.35 
 
 
621 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  43.42 
 
 
607 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  42.42 
 
 
616 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  39.69 
 
 
617 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  43.61 
 
 
611 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  42.91 
 
 
609 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  42.06 
 
 
608 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  43.22 
 
 
611 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  43.22 
 
 
611 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  43.22 
 
 
611 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  43.22 
 
 
611 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  43.22 
 
 
611 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  43.08 
 
 
607 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  43.22 
 
 
611 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  43.22 
 
 
611 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  37.76 
 
 
607 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4165  molecular chaperone DnaK  43.14 
 
 
611 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0072304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  40.11 
 
 
607 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  43.22 
 
 
611 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  39.5 
 
 
613 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  41.25 
 
 
626 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  42 
 
 
607 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  43.22 
 
 
611 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  43.27 
 
 
613 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  41.11 
 
 
615 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  39.71 
 
 
624 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  38.09 
 
 
602 aa  374  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  38.23 
 
 
612 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  41.44 
 
 
622 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  41.15 
 
 
610 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  40.68 
 
 
640 aa  369  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  42.4 
 
 
609 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  42.8 
 
 
617 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  38.17 
 
 
605 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5471  chaperone protein DnaK  41.77 
 
 
616 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  42.37 
 
 
620 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0378  molecular chaperone DnaK  39.46 
 
 
653 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  41.48 
 
 
614 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  39.07 
 
 
613 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1750  molecular chaperone DnaK  39.96 
 
 
690 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190119  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  42 
 
 
607 aa  371  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  42.3 
 
 
621 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  40.54 
 
 
636 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4180  molecular chaperone DnaK  41.02 
 
 
723 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612258 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  42 
 
 
610 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  36.9 
 
 
600 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  40.37 
 
 
612 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  40.96 
 
 
610 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  41.19 
 
 
617 aa  368  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  37.91 
 
 
620 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  42 
 
 
610 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  43.67 
 
 
617 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  41 
 
 
609 aa  365  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0369  molecular chaperone DnaK  39.1 
 
 
591 aa  365  1e-99  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  39.53 
 
 
605 aa  365  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  39.24 
 
 
611 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  37.12 
 
 
619 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1857  chaperone protein DnaK  41.41 
 
 
634 aa  365  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.48681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6949  molecular chaperone DnaK  41.84 
 
 
619 aa  364  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0440  chaperone protein DnaK  40.23 
 
 
618 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00195865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  40.67 
 
 
619 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  43.18 
 
 
618 aa  363  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2631  molecular chaperone DnaK  39.68 
 
 
627 aa  363  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0494047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4693  molecular chaperone DnaK  38.42 
 
 
643 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0919  molecular chaperone DnaK  38.74 
 
 
688 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.628241  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3115  heat shock protein 70  42.15 
 
 
619 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.157677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  40.27 
 
 
609 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>