More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0521 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  100 
 
 		 593 aa  1178    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  58.6 
 
 		 564 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  58.67 
 
 		 564 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  58.2 
 
 		 569 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  57.67 
 
 		 569 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  59.29 
 
 		 572 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  57.98 
 
 		 565 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  56.41 
 
 		 572 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  50.88 
 
 		 566 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  50.7 
 
 		 566 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  50.88 
 
 		 566 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  51.5 
 
 		 565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  54.39 
 
 		 572 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  50.8 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  49.02 
 
 		 563 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  51.72 
 
 		 568 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  44.86 
 
 		 563 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  45.29 
 
 		 556 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  45.11 
 
 		 556 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  44.93 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  45.29 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  45.11 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  44.95 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  43.99 
 
 		 563 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  44.93 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  44.93 
 
 		 556 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  45.16 
 
 		 559 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  44.68 
 
 		 559 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  45.16 
 
 		 559 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  44.68 
 
 		 559 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  44.92 
 
 		 584 aa  466  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  40.93 
 
 		 552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  42.69 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  37.29 
 
 		 617 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  42.33 
 
 		 607 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  42.94 
 
 		 607 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  40 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  42.13 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  39.21 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  39.73 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  39.73 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  39.73 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  39.73 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  39.73 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  39.08 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  39.73 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  37.07 
 
 		 612 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  39.73 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  43.47 
 
 		 607 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2311  chaperone protein DnaK  41.61 
 
 		 620 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000072076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  39.09 
 
 		 611 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0004  molecular chaperone DnaK  37.02 
 
 		 631 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0827361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  41.12 
 
 		 610 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  39.38 
 
 		 611 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4165  molecular chaperone DnaK  39.55 
 
 		 611 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0072304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  41.2 
 
 		 608 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  39.69 
 
 		 630 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  37.01 
 
 		 602 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  40.86 
 
 		 596 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  42.39 
 
 		 605 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  36.7 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  36.96 
 
 		 614 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  36.9 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  40.95 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  37.37 
 
 		 615 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  40.08 
 
 		 621 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  40.29 
 
 		 613 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  36.8 
 
 		 612 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  42.03 
 
 		 607 aa  365  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3142  chaperone protein DnaK  36.55 
 
 		 639 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105889  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2960  chaperone protein DnaK  36.38 
 
 		 639 aa  363  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3186  chaperone protein DnaK  36.38 
 
 		 639 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  39.93 
 
 		 627 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1328  molecular chaperone DnaK  36.09 
 
 		 631 aa  362  1e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  37.61 
 
 		 620 aa  361  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1250  molecular chaperone DnaK  39.46 
 
 		 630 aa  360  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  37.31 
 
 		 615 aa  360  4e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  40.41 
 
 		 609 aa  360  5e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  42.39 
 
 		 596 aa  360  6e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  42.39 
 
 		 596 aa  360  6e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  38.53 
 
 		 613 aa  359  9e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  37.87 
 
 		 621 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  41.28 
 
 		 617 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3919  chaperone protein DnaK  35.53 
 
 		 638 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  40.84 
 
 		 609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02520  chaperone, putative  37.98 
 
 		 644 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  40.94 
 
 		 636 aa  357  2.9999999999999997e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  41.87 
 
 		 607 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  38.36 
 
 		 611 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  40.63 
 
 		 624 aa  357  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  37.37 
 
 		 605 aa  356  5e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02320  heat shock protein 70, putative  39.96 
 
 		 640 aa  357  5e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0094  chaperone protein DnaK  37.98 
 
 		 634 aa  355  8.999999999999999e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.512015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  40.46 
 
 		 636 aa  355  1e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  36.42 
 
 		 620 aa  355  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6931  chaperone protein DnaK  39.38 
 
 		 637 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  38.43 
 
 		 613 aa  355  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  40.86 
 
 		 596 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0191  molecular chaperone DnaK  36.42 
 
 		 631 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  36.58 
 
 		 633 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>