More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4475 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  58.33 
 
 
556 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  58.51 
 
 
556 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  96.26 
 
 
563 aa  1124    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  58.15 
 
 
556 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  58.88 
 
 
563 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  58.33 
 
 
556 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  58.33 
 
 
559 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  58.33 
 
 
559 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  58.7 
 
 
556 aa  659    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  58.15 
 
 
559 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  58.15 
 
 
559 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  58.33 
 
 
556 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  100 
 
 
563 aa  1167    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  58.33 
 
 
556 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  58.15 
 
 
556 aa  652    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  46.96 
 
 
564 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  43.99 
 
 
593 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  46.87 
 
 
564 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  46.32 
 
 
565 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  46.44 
 
 
569 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  45.62 
 
 
569 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  44.84 
 
 
572 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  43.29 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  43.11 
 
 
566 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  43.29 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  45.47 
 
 
565 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  43.83 
 
 
572 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  44.64 
 
 
566 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  43.48 
 
 
572 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  42.26 
 
 
568 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  38.52 
 
 
552 aa  395  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  38.7 
 
 
584 aa  363  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  35.74 
 
 
630 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  35.93 
 
 
617 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  38.26 
 
 
608 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1551  chaperone protein DnaK  35.9 
 
 
607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  39.06 
 
 
605 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  39.63 
 
 
621 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  39.57 
 
 
607 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4299  chaperone protein DnaK  36.87 
 
 
614 aa  323  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  38.89 
 
 
607 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  38.95 
 
 
607 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  37.5 
 
 
616 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  37.8 
 
 
612 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  37.9 
 
 
613 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  38.74 
 
 
609 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  36.32 
 
 
627 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  35.13 
 
 
607 aa  319  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2956  chaperone protein DnaK  34.44 
 
 
626 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000146518  hitchhiker  0.00000122718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  37.22 
 
 
636 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  38.9 
 
 
622 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  34.35 
 
 
596 aa  317  4e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  35.04 
 
 
610 aa  316  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  37.63 
 
 
612 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  39.83 
 
 
613 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5471  chaperone protein DnaK  39.7 
 
 
616 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  39.39 
 
 
600 aa  313  4.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  40.04 
 
 
618 aa  313  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  40 
 
 
613 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2496  molecular chaperone DnaK  39.13 
 
 
615 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1207  chaperone protein DnaK  37.96 
 
 
620 aa  312  9e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.558053  normal  0.0128499 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  35.53 
 
 
602 aa  311  1e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0004  molecular chaperone DnaK  39.51 
 
 
631 aa  312  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0827361  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  36.7 
 
 
613 aa  312  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  40.04 
 
 
611 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  38.87 
 
 
613 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3246  chaperone protein DnaK  35.82 
 
 
624 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102286  hitchhiker  0.000258743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  35.99 
 
 
622 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  39.32 
 
 
618 aa  310  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  39.44 
 
 
611 aa  310  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4416  molecular chaperone DnaK  38.26 
 
 
638 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  39.47 
 
 
620 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1061  chaperone protein DnaK  35.55 
 
 
609 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00544599  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3389  molecular chaperone DnaK  37.9 
 
 
641 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  35.45 
 
 
617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  37.42 
 
 
610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4165  molecular chaperone DnaK  38.89 
 
 
611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0072304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  37.88 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4096  molecular chaperone DnaK  38.06 
 
 
639 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  38.48 
 
 
617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  39.14 
 
 
621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  39.57 
 
 
619 aa  307  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  38.09 
 
 
622 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  38.34 
 
 
622 aa  307  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0449  molecular chaperone DnaK  38.09 
 
 
622 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  38.09 
 
 
622 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10355  molecular chaperone DnaK  38.57 
 
 
625 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  38.27 
 
 
636 aa  306  6e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0440  chaperone protein DnaK  36.91 
 
 
618 aa  306  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00195865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2824  2-alkenal reductase  39.24 
 
 
485 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  38.57 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  38.57 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  38.57 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  38.57 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  38.57 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0313  chaperone protein DnaK  36.77 
 
 
626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000265757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0070  chaperone protein DnaK  37.43 
 
 
642 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  38.57 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  38.57 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0486  chaperone protein DnaK  35.45 
 
 
613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>