More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4769 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  57.98 
 
 
593 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  73.58 
 
 
564 aa  855    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3997  heat shock protein Hsp70  74.87 
 
 
564 aa  821    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.76093  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  100 
 
 
565 aa  1143    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7074  2-alkenal reductase  55.6 
 
 
569 aa  611  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0192  putative DnaK chaperone protein  54.27 
 
 
569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3774  2-alkenal reductase  54.43 
 
 
572 aa  598  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576175  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4256  heat shock protein 70  53.46 
 
 
572 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  0.890975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  50.35 
 
 
566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  50 
 
 
566 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  50 
 
 
566 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2505  2-alkenal reductase  51.15 
 
 
565 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104768  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3314  heat shock protein Hsp70  53.27 
 
 
568 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2958  Heat shock protein 70  49.38 
 
 
566 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1433  2-alkenal reductase  50.35 
 
 
572 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1886  heat shock protein Hsp70  50.18 
 
 
563 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0671  DnaK family protein HscC  46.7 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0678  DnaK family protein HscC  46.95 
 
 
556 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00616  Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription  46.95 
 
 
556 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2976  2-alkenal reductase  47.13 
 
 
556 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4190  Heat shock protein 70  46.61 
 
 
563 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0599  DnaK family protein HscC  46.95 
 
 
556 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2995  2-alkenal reductase  46.95 
 
 
556 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00605  hypothetical protein  46.95 
 
 
556 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0741  DnaK family protein HscC  46.68 
 
 
556 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4475  Heat shock protein 70  46.32 
 
 
563 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0776  chaperone protein HscC  45.82 
 
 
559 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.445694  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0702  chaperone protein HscC  45.82 
 
 
559 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.289778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0716  chaperone protein HscC  45.82 
 
 
559 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0763  chaperone protein HscC  45.82 
 
 
559 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.976238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3027  Heat shock protein 70  44.8 
 
 
584 aa  463  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1393  2-alkenal reductase  42.94 
 
 
552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.703416  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  38.34 
 
 
578 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12800  chaperone protein DnaK  37.63 
 
 
617 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0339068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  36.13 
 
 
621 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  39.21 
 
 
605 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  41.85 
 
 
607 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  38.45 
 
 
612 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0113  molecular chaperone DnaK  37.7 
 
 
613 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0112  molecular chaperone DnaK  37.7 
 
 
611 aa  365  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334679 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3072  chaperone protein DnaK  39.88 
 
 
636 aa  363  4e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0257567  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  36.95 
 
 
610 aa  363  6e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  40.89 
 
 
607 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  41.57 
 
 
622 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  36.55 
 
 
602 aa  361  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0303  molecular chaperone DnaK  37.33 
 
 
637 aa  361  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  41.65 
 
 
609 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  40.07 
 
 
616 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  42.77 
 
 
607 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  37.74 
 
 
617 aa  361  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  41.44 
 
 
596 aa  361  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  41.25 
 
 
607 aa  359  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  37.71 
 
 
612 aa  359  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01160  chaperone protein DnaK  36.73 
 
 
636 aa  358  9.999999999999999e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.548876  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02320  heat shock protein 70, putative  39.7 
 
 
640 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  37.88 
 
 
613 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  40.64 
 
 
607 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02520  chaperone, putative  39.51 
 
 
644 aa  357  5e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  41.21 
 
 
644 aa  356  6.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00650  chaperone protein DnaK  39.11 
 
 
642 aa  355  7.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0257003  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  40.04 
 
 
609 aa  355  1e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4447  molecular chaperone DnaK  40.44 
 
 
611 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000527769  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  35.16 
 
 
605 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  37.33 
 
 
637 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6427  molecular chaperone DnaK  42.18 
 
 
636 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.602415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2047  chaperone protein DnaK  40.04 
 
 
630 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  40.64 
 
 
611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  40.64 
 
 
611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  40.64 
 
 
611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4336  molecular chaperone DnaK  40.64 
 
 
611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67993e-38 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1328  molecular chaperone DnaK  39.02 
 
 
631 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  40.64 
 
 
611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4433  molecular chaperone DnaK  40.64 
 
 
611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000173012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2311  chaperone protein DnaK  41.25 
 
 
620 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000072076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2893  molecular chaperone DnaK  36.52 
 
 
635 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000189329  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31330  Heat Shock Protein 70  39.16 
 
 
674 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0297166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  41.6 
 
 
619 aa  353  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  40.24 
 
 
611 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4165  molecular chaperone DnaK  40.64 
 
 
611 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0072304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0803  molecular chaperone DnaK  40.64 
 
 
611 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000557012  hitchhiker  1.18258e-19 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2694  chaperone protein DnaK  37.54 
 
 
613 aa  353  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52908  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  38.12 
 
 
600 aa  353  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  41.37 
 
 
613 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  37.15 
 
 
618 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01680  heat shock protein, putative  35.61 
 
 
798 aa  352  7e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0366  chaperone protein DnaK  40.04 
 
 
617 aa  353  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  40.44 
 
 
611 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  37.09 
 
 
610 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  37.09 
 
 
610 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  37.93 
 
 
636 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  39.73 
 
 
653 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  37.41 
 
 
621 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  40.36 
 
 
622 aa  352  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  38.57 
 
 
620 aa  351  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1250  molecular chaperone DnaK  39.41 
 
 
630 aa  352  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  40.44 
 
 
613 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2057  chaperone protein DnaK  38.73 
 
 
607 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0790  molecular chaperone DnaK  38.39 
 
 
636 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0357423  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl415  molecular chaperone DnaK  39.24 
 
 
592 aa  349  7e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.847356  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  36.87 
 
 
638 aa  349  7e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>