More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6427 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  52.96 
 
 
638 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  52.96 
 
 
638 aa  654    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  55.7 
 
 
658 aa  655    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  55.45 
 
 
637 aa  685    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  57.7 
 
 
636 aa  723    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  54.05 
 
 
640 aa  670    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  54.98 
 
 
646 aa  669    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  56.52 
 
 
641 aa  688    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  52.66 
 
 
640 aa  664    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1313  chaperone protein DnaK  52.8 
 
 
633 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3821  chaperone protein DnaK  52.63 
 
 
638 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0850  molecular chaperone DnaK  56.69 
 
 
623 aa  665    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  59.25 
 
 
637 aa  677    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1126  molecular chaperone DnaK  53.72 
 
 
639 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  52.95 
 
 
644 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  52.95 
 
 
644 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4195  molecular chaperone DnaK  51.4 
 
 
638 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.697831  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0923  heat shock protein Hsp70  55.79 
 
 
645 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.831723  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  54.06 
 
 
613 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  58.08 
 
 
630 aa  733    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0554  molecular chaperone DnaK  53.33 
 
 
634 aa  642    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  54.38 
 
 
639 aa  662    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  60.03 
 
 
630 aa  694    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  61.66 
 
 
629 aa  766    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  61.89 
 
 
633 aa  768    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0919  molecular chaperone DnaK  57.62 
 
 
688 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.628241  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2811  heat shock protein Hsp70  55.83 
 
 
640 aa  687    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0535458  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  53.98 
 
 
636 aa  663    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  57.17 
 
 
634 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  58.08 
 
 
637 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  60.72 
 
 
639 aa  736    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  57.39 
 
 
637 aa  715    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  59.65 
 
 
637 aa  737    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  57.46 
 
 
638 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  54.67 
 
 
637 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  55.05 
 
 
638 aa  652    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1644  molecular chaperone DnaK  54.16 
 
 
628 aa  669    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000171491  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  57.41 
 
 
645 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  62.25 
 
 
634 aa  778    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2580  molecular chaperone DnaK  58.02 
 
 
749 aa  678    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  53.34 
 
 
644 aa  660    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  55.5 
 
 
639 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  56.71 
 
 
612 aa  662    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1580  chaperone DnaK  56.92 
 
 
632 aa  681    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4328  molecular chaperone DnaK  57.7 
 
 
609 aa  675    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.977158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2173  molecular chaperone DnaK  77.43 
 
 
641 aa  1004    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  58.49 
 
 
616 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  56.69 
 
 
633 aa  701    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  54.22 
 
 
635 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0471  molecular chaperone DnaK  51.58 
 
 
635 aa  645    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0555822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0212  molecular chaperone DnaK  55.25 
 
 
639 aa  637    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2733  molecular chaperone DnaK  56.2 
 
 
643 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000184427  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  59.86 
 
 
632 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0751  chaperone DnaK  56.23 
 
 
640 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.805739  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1182  molecular chaperone DnaK  53.56 
 
 
638 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  53.04 
 
 
620 aa  642    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  55.5 
 
 
633 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  52.23 
 
 
644 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  60.03 
 
 
632 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0552  chaperone protein DnaK  51.4 
 
 
631 aa  637    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  58.36 
 
 
644 aa  698    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2076  molecular chaperone DnaK  57.75 
 
 
629 aa  689    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000834222  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  53.73 
 
 
642 aa  659    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  54.69 
 
 
643 aa  672    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  56.38 
 
 
634 aa  698    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  57.02 
 
 
622 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  60.8 
 
 
636 aa  712    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1987  molecular chaperone DnaK  53.43 
 
 
639 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  55.89 
 
 
636 aa  698    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  53.61 
 
 
632 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  60.11 
 
 
619 aa  680    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  55.8 
 
 
619 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  53.74 
 
 
635 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  60.88 
 
 
638 aa  752    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4012  molecular chaperone DnaK  57.75 
 
 
670 aa  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0957  molecular chaperone DnaK  53.72 
 
 
639 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0995  molecular chaperone DnaK  53.72 
 
 
639 aa  668    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0204392  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  55.35 
 
 
671 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0969  molecular chaperone DnaK  54.18 
 
 
638 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.291129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  63.69 
 
 
623 aa  789    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  53.23 
 
 
610 aa  656    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  55.76 
 
 
636 aa  661    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  52.63 
 
 
637 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0731  molecular chaperone DnaK  54.38 
 
 
615 aa  638    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0260  chaperone protein DnaK  68.6 
 
 
631 aa  862    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000679049  normal  0.867364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  55.85 
 
 
641 aa  711    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  61.66 
 
 
653 aa  686    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0959  molecular chaperone DnaK  53.72 
 
 
639 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0334727  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  60.49 
 
 
618 aa  674    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1089  molecular chaperone DnaK  55.79 
 
 
626 aa  677    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  57.12 
 
 
636 aa  702    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  56.92 
 
 
640 aa  710    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  54.28 
 
 
638 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2511  molecular chaperone DnaK  55.42 
 
 
637 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127474  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  57.02 
 
 
622 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  57.37 
 
 
622 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3362  molecular chaperone DnaK  53.87 
 
 
641 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00483084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2166  molecular chaperone DnaK  53.88 
 
 
636 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0684659  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3218  molecular chaperone DnaK  55.34 
 
 
646 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1328  molecular chaperone DnaK  55.61 
 
 
631 aa  698    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>