More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1399 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  59.66 
 
 
638 aa  745    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  59.66 
 
 
638 aa  745    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0675  molecular chaperone DnaK  62.54 
 
 
658 aa  735    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.549648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  100 
 
 
637 aa  1283    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0033  molecular chaperone DnaK  65.15 
 
 
636 aa  830    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4727  molecular chaperone DnaK  58.91 
 
 
641 aa  726    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_002950  PG1208  molecular chaperone DnaK  58.36 
 
 
640 aa  732    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0628  molecular chaperone DnaK  62.05 
 
 
646 aa  749    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  60.99 
 
 
609 aa  706    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  58.48 
 
 
641 aa  729    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0928  molecular chaperone DnaK  57.63 
 
 
640 aa  731    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.689493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2635  molecular chaperone DnaK  60.03 
 
 
688 aa  721    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0170334  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4395  molecular chaperone DnaK  61.55 
 
 
611 aa  703    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00031537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2125  molecular chaperone DnaK  62.85 
 
 
637 aa  766    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.864242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1126  molecular chaperone DnaK  57.79 
 
 
639 aa  712    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4505  dnaK protein  56.85 
 
 
638 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.493452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4213  molecular chaperone DnaK  61.16 
 
 
611 aa  703    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000284516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4051  molecular chaperone DnaK  61.16 
 
 
611 aa  703    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4061  molecular chaperone DnaK  61.16 
 
 
611 aa  703    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2326  molecular chaperone DnaK  59.74 
 
 
650 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  59.56 
 
 
644 aa  754    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  59.56 
 
 
644 aa  754    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4195  molecular chaperone DnaK  57.01 
 
 
638 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.697831  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0923  heat shock protein Hsp70  58.62 
 
 
645 aa  714    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.831723  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  57.23 
 
 
613 aa  707    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  57.77 
 
 
630 aa  725    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2785  molecular chaperone DnaK  59.54 
 
 
647 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134796  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3433  molecular chaperone DnaK  62.38 
 
 
620 aa  723    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0457031  normal  0.0513788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  58.79 
 
 
639 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  63.32 
 
 
630 aa  770    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0141  molecular chaperone DnaK  61.45 
 
 
629 aa  766    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  62.58 
 
 
633 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3322  molecular chaperone DnaK  59.74 
 
 
650 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2811  heat shock protein Hsp70  59.03 
 
 
640 aa  741    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0535458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0763  molecular chaperone DnaK  58.54 
 
 
638 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.240702  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1173  molecular chaperone DnaK  59.15 
 
 
636 aa  738    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0107  molecular chaperone DnaK  64.99 
 
 
634 aa  830    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3839  molecular chaperone DnaK  58.76 
 
 
650 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0621  molecular chaperone DnaK  62.81 
 
 
637 aa  766    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2303  molecular chaperone DnaK  59.64 
 
 
639 aa  732    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1893  molecular chaperone DnaK  63.39 
 
 
637 aa  767    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.457552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2674  molecular chaperone DnaK  60.13 
 
 
637 aa  733    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3532  molecular chaperone DnaK  64.95 
 
 
638 aa  825    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00119444  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1023  molecular chaperone DnaK  63.85 
 
 
637 aa  782    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  59.5 
 
 
638 aa  714    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4539  molecular chaperone DnaK  61.16 
 
 
611 aa  703    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1797  molecular chaperone DnaK  56.68 
 
 
645 aa  709    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0693908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  60.88 
 
 
634 aa  753    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  58.91 
 
 
644 aa  738    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3555  molecular chaperone DnaK  61.91 
 
 
639 aa  782    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  62.35 
 
 
612 aa  745    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1308  molecular chaperone DnaK  59.57 
 
 
650 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1580  chaperone DnaK  65.51 
 
 
632 aa  776    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4328  molecular chaperone DnaK  59.93 
 
 
609 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.977158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0429  molecular chaperone DnaK  61.38 
 
 
633 aa  763    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2054  molecular chaperone DnaK  59.13 
 
 
635 aa  729    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  59.62 
 
 
610 aa  734    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0212  molecular chaperone DnaK  58.43 
 
 
639 aa  717    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2733  molecular chaperone DnaK  58.63 
 
 
643 aa  702    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000184427  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  62.99 
 
 
632 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0751  chaperone DnaK  58.26 
 
 
640 aa  707    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.805739  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3961  molecular chaperone DnaK  59.08 
 
 
653 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727521  normal  0.0784984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1182  molecular chaperone DnaK  57.94 
 
 
638 aa  707    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  59.78 
 
 
620 aa  727    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0391  molecular chaperone DnaK  61.07 
 
 
633 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  58.1 
 
 
644 aa  737    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  62.99 
 
 
632 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2922  molecular chaperone DnaK  59.11 
 
 
648 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797914  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0552  chaperone protein DnaK  57.01 
 
 
631 aa  712    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  67.71 
 
 
644 aa  816    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0010  molecular chaperone DnaK  59.38 
 
 
642 aa  739    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0949466  normal  0.47597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  59.19 
 
 
643 aa  743    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  61.07 
 
 
634 aa  780    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0268  molecular chaperone DnaK  59.08 
 
 
650 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0784  chaperone DnaK  63.74 
 
 
636 aa  779    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1987  molecular chaperone DnaK  57.83 
 
 
639 aa  712    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0679  molecular chaperone DnaK  62.95 
 
 
636 aa  787    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3101  molecular chaperone DnaK  59.4 
 
 
632 aa  750    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  61.59 
 
 
619 aa  731    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  61.44 
 
 
619 aa  735    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  61.24 
 
 
635 aa  726    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1306  molecular chaperone DnaK  61.3 
 
 
638 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35463  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0957  molecular chaperone DnaK  57.94 
 
 
639 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0995  molecular chaperone DnaK  57.94 
 
 
639 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0204392  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1900  molecular chaperone DnaK  60.19 
 
 
671 aa  751    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393588  normal  0.969601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0969  molecular chaperone DnaK  58.32 
 
 
638 aa  708    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.291129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  58.35 
 
 
623 aa  728    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  58.94 
 
 
610 aa  728    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3001  chaperone protein DnaK  59.97 
 
 
636 aa  732    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0646  molecular chaperone DnaK  59.08 
 
 
650 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  57.48 
 
 
637 aa  716    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0752  molecular chaperone DnaK  59.08 
 
 
650 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0260  chaperone protein DnaK  60.07 
 
 
631 aa  703    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000679049  normal  0.867364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1036  chaperone protein DnaK  62.83 
 
 
641 aa  805    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000619516  hitchhiker  0.000149965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0510  chaperone protein DnaK  63.65 
 
 
653 aa  772    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0638299  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0959  molecular chaperone DnaK  57.79 
 
 
639 aa  711    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0334727  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  60.73 
 
 
618 aa  703    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1404  molecular chaperone DnaK  62.75 
 
 
636 aa  807    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00594741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0864  molecular chaperone DnaK  62.62 
 
 
640 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.873902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2302  molecular chaperone DnaK  58.59 
 
 
638 aa  727    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679983  normal  0.117002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>